122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3388 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
290 aa  580  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  80.39 
 
 
153 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  74.47 
 
 
149 aa  225  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  85.82 
 
 
153 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  71.62 
 
 
151 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0681  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  74 
 
 
155 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1500  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  63.76 
 
 
159 aa  165  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.33 
 
 
140 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  49.22 
 
 
149 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.31 
 
 
159 aa  89  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  43.94 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.86 
 
 
152 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.53 
 
 
141 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3017  hypothetical protein  41.18 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  38.33 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  35.38 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.48 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.88 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.23 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.15 
 
 
140 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0312  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.08 
 
 
150 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.31 
 
 
139 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.6 
 
 
136 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4623  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.98 
 
 
151 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.910607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.46 
 
 
151 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  38.76 
 
 
152 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  41.03 
 
 
148 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.03 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  37.82 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3725  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.59 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905098  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.25 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  33.98 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  32.84 
 
 
141 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27482  predicted protein  37.82 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.02 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.64 
 
 
137 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.772873  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  32.09 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  38.02 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  36.92 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.8 
 
 
142 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.2 
 
 
140 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.9 
 
 
144 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  42.74 
 
 
144 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.59 
 
 
148 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.09 
 
 
163 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15578  predicted protein  35.07 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.96534  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.87 
 
 
143 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0584  hypothetical protein  38.14 
 
 
154 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.28 
 
 
140 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1882  YeeE/YedE family membrane protein  39.34 
 
 
140 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  38.4 
 
 
145 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0960  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.79 
 
 
154 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  34.62 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  36.84 
 
 
159 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.12 
 
 
140 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.6 
 
 
151 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.5 
 
 
159 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.86 
 
 
152 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  34.97 
 
 
159 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  35.9 
 
 
143 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  36.19 
 
 
137 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4703  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.12 
 
 
151 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0458  hypothetical protein  34.35 
 
 
145 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2900  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.52 
 
 
162 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2817  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.4 
 
 
143 aa  59.3  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0393902  normal  0.331384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  34.96 
 
 
160 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.44 
 
 
142 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.51 
 
 
145 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  41.23 
 
 
137 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  41.18 
 
 
143 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1879  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.18 
 
 
139 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4075  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.94 
 
 
161 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135542  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.99 
 
 
137 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.99 
 
 
137 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0117  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.87 
 
 
149 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0807973 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.19 
 
 
160 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2106  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.71 
 
 
157 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.653273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.67 
 
 
157 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  32.85 
 
 
348 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.54 
 
 
137 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  38.32 
 
 
143 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.09 
 
 
138 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2349  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 
161 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.94 
 
 
159 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.73 
 
 
152 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4147  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.5 
 
 
148 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1087  hypothetical protein  35.38 
 
 
140 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.64 
 
 
157 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1715  twin-arginine translocation pathway signal  36.75 
 
 
145 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0335  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.5 
 
 
139 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  36.79 
 
 
140 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0731  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.05 
 
 
156 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.99 
 
 
167 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  36.97 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  36.97 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  36.97 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  36.97 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  36.97 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  36.97 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>