75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0170 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.33 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  34.92 
 
 		 136 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.85 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.21 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.07 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  32.14 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.58 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.43 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  32.54 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.07 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.98 
 
 		 290 aa  68.2  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  30.95 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.65 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.66 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  29.23 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.97 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  34.43 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 647 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  33.61 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.74 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  31.88 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.56 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  30.22 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.8 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.16 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  30 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.4 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.23 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  34.74 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  34.74 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.46 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.21 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.2 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  34.68 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.17 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.06 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0268  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.59 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  30.08 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  25.93 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  32.26 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  28.95 
 
 		 399 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  31.15 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  29.06 
 
 		 419 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  30.88 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.67 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  30.41 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  26.28 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  25.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.89 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1879  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.24 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2447  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.56 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.43 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4147  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.51 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  27.91 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0312  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.44 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  24 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.7 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  21.78 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.23 
 
 		 218 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  29.63 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.7 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.63 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  27.69 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.86 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0458  hypothetical protein  32 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  22.55 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1715  twin-arginine translocation pathway signal  31.31 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  25.77 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.24 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>