40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0348 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  353  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  50.67 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.99 
 
 
218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  41.51 
 
 
419 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  41.22 
 
 
237 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  47.15 
 
 
647 aa  92.8  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  35.8 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  37.97 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.08 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.19 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  41.98 
 
 
399 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  36.36 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  34.39 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.71 
 
 
218 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  35.71 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  35.03 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  40.68 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  40.62 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.36 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  40.13 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.33 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  33.13 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  31.4 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.99 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  35.37 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.2 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  27.13 
 
 
373 aa  52.4  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  35.82 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.43 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.9 
 
 
139 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.84 
 
 
151 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.39 
 
 
354 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.3 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.02 
 
 
352 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  39.17 
 
 
344 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.81 
 
 
145 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  27.91 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.41 
 
 
374 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.66 
 
 
155 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>