52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2803 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 183 aa  356  8e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  74.86 
 
 		 180 aa  236  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.56 
 
 		 176 aa  97.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.12 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  39.04 
 
 		 192 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  37.66 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.09 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.57 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  37.97 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  35.82 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  33.15 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.8 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  29.17 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  35.77 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  33.74 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.58 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  34.23 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  33.85 
 
 		 647 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  34.97 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  30.73 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  34.85 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.16 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.33 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  28.65 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  39.16 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  30.2 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  34.43 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  25.9 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  25.19 
 
 		 373 aa  52.4  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  40.68 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.22 
 
 		 330 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.58 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.31 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  46 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 		 462 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.65 
 
 		 371 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.91 
 
 		 407 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.51 
 
 		 352 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.73 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  46.51 
 
 		 344 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  29.51 
 
 		 343 aa  42.4  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2349  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.74 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  29.27 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44 
 
 		 160 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  42 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  34.82 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  27.61 
 
 		 352 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  27.61 
 
 		 352 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  25.35 
 
 		 359 aa  40.8  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  25.35 
 
 		 359 aa  40.8  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  27.61 
 
 		 352 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>