48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0789 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  362  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.41 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  50.67 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 		 419 aa  135  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 647 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.79 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  50.79 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  50.41 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  42.22 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  43.54 
 
 		 399 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.62 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  34.91 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.16 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  31.87 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.09 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  32.35 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.71 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  36.22 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  40.15 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  29.73 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.65 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  27.37 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.97 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.4 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.32 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  34.92 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  29.49 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  34.45 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  38.53 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  30.56 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  30.08 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.31 
 
 		 352 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  29.19 
 
 		 344 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.78 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  27.48 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.66 
 
 		 139 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  26.72 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.6 
 
 		 368 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.81 
 
 		 142 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.12 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.03 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.22 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.85 
 
 		 138 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.56 
 
 		 354 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.36 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 157 aa  41.2  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.1 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  27.2 
 
 		 137 aa  41.2  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>