42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0557 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  53.41 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  48.05 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  43.58 
 
 
419 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  41.72 
 
 
237 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.57 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  36 
 
 
218 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  36.57 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  39.11 
 
 
399 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  37.64 
 
 
647 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  37.72 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.84 
 
 
175 aa  82  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  36.2 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.93 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  33.12 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.33 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  32.95 
 
 
175 aa  72  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.37 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  31.43 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  35.9 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  29.68 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.87 
 
 
185 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.52 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.33 
 
 
183 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.06 
 
 
175 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.52 
 
 
143 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.13 
 
 
141 aa  48.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.82 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.58 
 
 
139 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  32 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.69 
 
 
145 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  33.33 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.43 
 
 
352 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.89 
 
 
136 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.46 
 
 
145 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  26.23 
 
 
168 aa  42.4  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.37 
 
 
151 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  34.17 
 
 
344 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.77 
 
 
140 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.72 
 
 
159 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>