77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3330 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  66.9 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.09 
 
 		 167 aa  189  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  64.44 
 
 		 152 aa  187  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  56.39 
 
 		 136 aa  158  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.15 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0268  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.33 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.21 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.76 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  50.74 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  50.78 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  50.75 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  35.43 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.57 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  30.43 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.54 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.56 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  37.82 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.44 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.56 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.94 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  32.23 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.98 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.05 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.47 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.46 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.23 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.82 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  26.76 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  33.98 
 
 		 186 aa  50.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  30.43 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.47 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  30.3 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.04 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.3 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  29.37 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2106  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.653273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  27.34 
 
 		 373 aa  48.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.27 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  25.81 
 
 		 647 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  26.56 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  30.19 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  30.77 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  32.04 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  31 
 
 		 392 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27482  predicted protein  31 
 
 		 338 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.87 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.97 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.43 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  27.2 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  24.62 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  27.61 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  24.17 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.97 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  25.41 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.01 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  23.57 
 
 		 348 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  29.73 
 
 		 150 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  30.95 
 
 		 152 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  34.29 
 
 		 143 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  30.49 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  25 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.72 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  26.15 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.94 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.94 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  26.4 
 
 		 237 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1500  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.37 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  24.19 
 
 		 399 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15578  predicted protein  33.33 
 
 		 348 aa  40.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.96534  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2900  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.49 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.74 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>