120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2424 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  75.33 
 
 
153 aa  221  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  75.91 
 
 
149 aa  215  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  74.64 
 
 
290 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  77.7 
 
 
153 aa  192  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0681  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  68.67 
 
 
155 aa  163  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1500  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  64.38 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.39 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  46.27 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  37.24 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  39.2 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.16 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.28 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  39.17 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.21 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  36.23 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  28.47 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.7 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.17 
 
 
141 aa  67  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  33.88 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  34.71 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4623  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.910607  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.82 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2076  hypothetical protein  38.17 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.1 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1998  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.17 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2900  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.23 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  32.61 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  34.81 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.31 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.4 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.772873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.5 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  37.29 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0458  hypothetical protein  34.06 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3725  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.69 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905098  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  35.34 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.15 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2106  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.83 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.653273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.33 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.08 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  38.98 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0960  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.34 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  36.89 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  41.24 
 
 
392 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27482  predicted protein  41.24 
 
 
338 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.68 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.97 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0584  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.29 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.68 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.14 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.44 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.51 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3017  hypothetical protein  39.5 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.88 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.79 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.86 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.36 
 
 
140 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  40.95 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  32.87 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  37.38 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15578  predicted protein  32.89 
 
 
348 aa  57  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.96534  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1879  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.67 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  40.19 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1882  YeeE/YedE family membrane protein  36.67 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.64 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.12 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  34.17 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.86 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.34 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0312  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.04 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0117  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.59 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0807973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  37.39 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.36 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.62 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.35 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0130  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  39.22 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.4 
 
 
176 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0335  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.79 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  38.46 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  33.06 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.06 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4703  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.32 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.96 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  31.48 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2817  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.36 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0393902  normal  0.331384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.61 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.61 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4147  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.43 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.59 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.11 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  29.73 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.5 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1087  hypothetical protein  35.4 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544428  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.45 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2349  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.169247 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>