89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1372 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.379116  hitchhiker  0.00015197 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5966  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  63.33 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0312  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  67.9 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.74 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.6 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.772873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.89 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.01 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.72 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  42.55 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.55 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4623  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.62 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.910607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.4 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2349  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.75 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4147  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.32 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0117  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.78 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0807973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3017  hypothetical protein  43.82 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  44.68 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000103  predicted transporter component  43.96 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1879  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.21 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.189213  normal  0.0138724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.36 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4703  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.72 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.43 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  44.44 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2321  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.63 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.82 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4037  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.82 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  39.33 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  42.05 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1882  YeeE/YedE family membrane protein  43.82 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  39.33 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.23 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.3 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3556  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.57 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  37.89 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1684  YeeE/YedE  44.44 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.11 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.05 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.67 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4716  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.86 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3333  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.22 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1301  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.32 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0335  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.95 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05710  hypothetical protein  41.67 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.2 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.09 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0232  YeeE/YedE  41.57 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  45.21 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  45.05 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.57 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0458  hypothetical protein  39.78 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2447  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.21 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.68 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.444029  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.44 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0584  hypothetical protein  40.66 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2437  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.3 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.224187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1408  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.78 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  38.89 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  42.39 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  39.36 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  38.16 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2817  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.96 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0393902  normal  0.331384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.36 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.11 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0130  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.94 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1087  hypothetical protein  38.36 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0960  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  38.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0939  hypothetical protein  38.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  38.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  38.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  38.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  38.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  38.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  35.23 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15578  predicted protein  40.22 
 
 		 348 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.96534  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1715  twin-arginine translocation pathway signal  39.47 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2900  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.11 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27482  predicted protein  42.86 
 
 		 338 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  42.86 
 
 		 392 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.21 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2106  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.56 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.653273  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  34.04 
 
 		 348 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3725  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.34 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905098  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0731  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.75 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0856  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.23 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000840369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>