36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0403 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  693    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  70.66 
 
 
352 aa  496  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  71.92 
 
 
352 aa  494  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  51.01 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  51.28 
 
 
367 aa  331  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  51.7 
 
 
361 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  48.75 
 
 
365 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  51.81 
 
 
363 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  46.44 
 
 
353 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  48.46 
 
 
361 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  44.99 
 
 
349 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  44.72 
 
 
364 aa  279  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  48.58 
 
 
360 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  47.71 
 
 
368 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  44.96 
 
 
356 aa  267  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  47.37 
 
 
362 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  43.56 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  41.56 
 
 
381 aa  246  6e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  40.75 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  37.71 
 
 
357 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  37.75 
 
 
354 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  37.88 
 
 
353 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  42.42 
 
 
366 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  35.37 
 
 
345 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  45.03 
 
 
171 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.41 
 
 
138 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  29.3 
 
 
166 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  30.65 
 
 
151 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  30.65 
 
 
151 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  30.65 
 
 
151 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  31.45 
 
 
151 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  29.93 
 
 
371 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  30.65 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.58 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.27 
 
 
373 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>