29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1636 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  52.38 
 
 
349 aa  126  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  53.6 
 
 
367 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  52.34 
 
 
368 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  53.17 
 
 
353 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  53.17 
 
 
364 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  54.76 
 
 
365 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  52.42 
 
 
362 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  45.06 
 
 
363 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  52.42 
 
 
356 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  50 
 
 
354 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  45.03 
 
 
356 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  53.6 
 
 
361 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  45.93 
 
 
354 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  45.24 
 
 
381 aa  107  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  50.93 
 
 
360 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  40 
 
 
369 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  46.83 
 
 
352 aa  104  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  40 
 
 
357 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  55.79 
 
 
361 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  50.91 
 
 
352 aa  101  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  47.22 
 
 
337 aa  100  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  48.25 
 
 
345 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  47.37 
 
 
353 aa  93.6  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  33.33 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  31.97 
 
 
151 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  31.97 
 
 
151 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  30 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>