54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2081 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  696    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  61.02 
 
 
360 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  56.01 
 
 
349 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  56.76 
 
 
362 aa  358  7e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  57.23 
 
 
353 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  51.46 
 
 
354 aa  332  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  52.69 
 
 
368 aa  326  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  51.29 
 
 
367 aa  325  5e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  50.74 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  52.56 
 
 
361 aa  319  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  49.57 
 
 
364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  52.2 
 
 
365 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  53.92 
 
 
363 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  48.6 
 
 
381 aa  295  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  46.75 
 
 
369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  48.35 
 
 
361 aa  276  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  44.51 
 
 
352 aa  263  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  44.96 
 
 
356 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  45.83 
 
 
353 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  42.77 
 
 
354 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  42.65 
 
 
352 aa  228  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  45.4 
 
 
345 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  39.54 
 
 
357 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  45.37 
 
 
366 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  52.42 
 
 
171 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  33.56 
 
 
156 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  35.17 
 
 
157 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  31.25 
 
 
156 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  30.56 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  30.61 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  36.22 
 
 
151 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  34.65 
 
 
151 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  34.65 
 
 
151 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  37.17 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  31.16 
 
 
151 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30 
 
 
371 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  29.32 
 
 
166 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  29.05 
 
 
405 aa  46.6  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.28 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.11 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  30.28 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  30.28 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  30.28 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  31.06 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  30.43 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  30.28 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  30 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  30 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  31.78 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  31.65 
 
 
375 aa  43.9  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30 
 
 
354 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  29.37 
 
 
371 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>