42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0820 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  78.27 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  70.25 
 
 		 365 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  62.36 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  57.06 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  54.57 
 
 		 354 aa  384  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  57.94 
 
 		 353 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  51.78 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  53.35 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  52.71 
 
 		 356 aa  332  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  51.75 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  51.19 
 
 		 361 aa  323  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  51.95 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  51.7 
 
 		 356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  49.71 
 
 		 352 aa  309  4e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  52.33 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  46.75 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  45.23 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  47.19 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  45.04 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  44.01 
 
 		 353 aa  235  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  44.51 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  45.87 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  35.51 
 
 		 357 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  53.6 
 
 		 171 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  31.01 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  32.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  32.33 
 
 		 151 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  32.33 
 
 		 151 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  31.65 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  27.33 
 
 		 159 aa  53.1  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  35.05 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  25.85 
 
 		 156 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  25.85 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  25.85 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  28.37 
 
 		 157 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  36.36 
 
 		 371 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.73 
 
 		 402 aa  46.2  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  30.61 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.91 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.93 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  35.14 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>