45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  722    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  77.09 
 
 		 381 aa  543  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  50.45 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  49.03 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  48.01 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  47.3 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  47.72 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  48.34 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  48 
 
 		 337 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  46.97 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  45.4 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  44.85 
 
 		 365 aa  281  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  44.57 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  45.28 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  42.86 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  44.51 
 
 		 361 aa  258  9e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  40.71 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  40.83 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  37.91 
 
 		 354 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  39.88 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  36.07 
 
 		 357 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  38.39 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  37.42 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  40.31 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  31.94 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  31.94 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  30.08 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  31.25 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  32.12 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  31.69 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  30.77 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  30.77 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  30.77 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  25.83 
 
 		 159 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  31.06 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  34.23 
 
 		 344 aa  49.7  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  28.09 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  28.09 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.56 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  32.2 
 
 		 373 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.33 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  26.44 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  31.03 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.94 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>