47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3168 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  716    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  70.25 
 
 		 361 aa  484  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  66.02 
 
 		 364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  70.28 
 
 		 363 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  55.04 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  55.46 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  56.1 
 
 		 353 aa  338  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  52.81 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  52.2 
 
 		 356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  49.7 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  53.77 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  48.51 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  49.55 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  50.57 
 
 		 362 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  51.3 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  45.51 
 
 		 381 aa  295  7e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  48.26 
 
 		 352 aa  294  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  44.62 
 
 		 369 aa  292  7e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  46.72 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  46 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  45.4 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  44.38 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  48.91 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  35.96 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  56.56 
 
 		 171 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  30.13 
 
 		 166 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  29.85 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  30.34 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  29.85 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  28.57 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  27.59 
 
 		 156 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  33.63 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  27.33 
 
 		 159 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  26.9 
 
 		 156 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  26.21 
 
 		 156 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  32.32 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  33.61 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.75 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.91 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  26.12 
 
 		 157 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.48 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.26 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.66 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  29.27 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.8 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  35.16 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  32.23 
 
 		 373 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>