37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2467 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  679    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  56.01 
 
 
356 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  57.36 
 
 
360 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  55.03 
 
 
362 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  54.52 
 
 
337 aa  339  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  49.3 
 
 
367 aa  338  7e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  51.47 
 
 
354 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  52.92 
 
 
353 aa  335  9e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  53.22 
 
 
368 aa  331  9e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  51.75 
 
 
361 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  54.91 
 
 
363 aa  318  7e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  47.11 
 
 
381 aa  317  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  49.7 
 
 
365 aa  315  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  49.35 
 
 
369 aa  310  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  47.54 
 
 
364 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  51.36 
 
 
361 aa  295  8e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  46.7 
 
 
352 aa  293  3e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  45.27 
 
 
356 aa  288  7e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  47.84 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  39.82 
 
 
354 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  42.02 
 
 
353 aa  242  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  40.23 
 
 
357 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  40.49 
 
 
345 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  44.55 
 
 
366 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  52.38 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  37.04 
 
 
151 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  36.3 
 
 
151 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  36.3 
 
 
151 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  37.5 
 
 
151 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  34.27 
 
 
156 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  33.57 
 
 
156 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  33.57 
 
 
156 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  34.78 
 
 
157 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  31.03 
 
 
159 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  28.85 
 
 
166 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  35.05 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.59 
 
 
216 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>