37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2089 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  714    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  52.83 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  59.57 
 
 		 363 aa  346  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  50.82 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  53.82 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  50.28 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  52.07 
 
 		 360 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  52.2 
 
 		 349 aa  330  3e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  55.98 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  49.72 
 
 		 381 aa  322  4e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  50.56 
 
 		 365 aa  319  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  49.03 
 
 		 364 aa  318  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  51.1 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  49.03 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  46.32 
 
 		 354 aa  308  6.999999999999999e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  47.97 
 
 		 361 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  46.78 
 
 		 356 aa  265  7e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  40.76 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  46.01 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  42.62 
 
 		 352 aa  236  7e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  40.87 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  37.57 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  44.27 
 
 		 345 aa  212  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  45 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  52.34 
 
 		 171 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  35.17 
 
 		 156 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  34.93 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  34.48 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  35.29 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  35.43 
 
 		 151 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  30 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  34.48 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  34.65 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  34.65 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  31.62 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  32.28 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.6 
 
 		 402 aa  46.2  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>