36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00560 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  746    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  76.23 
 
 		 369 aa  552  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  48.63 
 
 		 368 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  47.45 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  45.83 
 
 		 349 aa  318  1e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  48.18 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  45.82 
 
 		 367 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  49.06 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  50.63 
 
 		 353 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  44.78 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  43.32 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  44.84 
 
 		 365 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  47.56 
 
 		 363 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  44.14 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  45.86 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  43.48 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  41.67 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  42.95 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  35.85 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  36.86 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  39.51 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  37.5 
 
 		 352 aa  208  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  39.51 
 
 		 345 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  41.9 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  45.24 
 
 		 171 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  31.34 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  31.21 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  30.6 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  30.6 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  30.41 
 
 		 156 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  30.77 
 
 		 159 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  28.77 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  31.03 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  29.71 
 
 		 157 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  27.56 
 
 		 166 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.48 
 
 		 402 aa  49.7  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>