45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3245 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  705    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  78.27 
 
 
361 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  70.28 
 
 
365 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  61.67 
 
 
364 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  57.82 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  55.84 
 
 
354 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  55.19 
 
 
368 aa  355  5e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  57.14 
 
 
353 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  54.98 
 
 
360 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  53.15 
 
 
337 aa  335  7e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  52.68 
 
 
356 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  52.42 
 
 
349 aa  332  9e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  48.96 
 
 
361 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  51.81 
 
 
356 aa  311  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  49.86 
 
 
352 aa  310  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  50.87 
 
 
362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  47.68 
 
 
381 aa  295  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  46.77 
 
 
369 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  47.34 
 
 
352 aa  288  7e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  44.07 
 
 
354 aa  262  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  43.98 
 
 
353 aa  245  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  43.41 
 
 
345 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  45.99 
 
 
366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  33.24 
 
 
357 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  45.06 
 
 
171 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  31.21 
 
 
166 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  33.09 
 
 
151 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  31.58 
 
 
151 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  31.58 
 
 
151 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  31.58 
 
 
151 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  36.36 
 
 
343 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.51 
 
 
402 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.03 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  29.61 
 
 
159 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  28.97 
 
 
156 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  36.51 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  28.26 
 
 
157 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  28.28 
 
 
156 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  34.43 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  26.9 
 
 
156 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.6 
 
 
215 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.39 
 
 
412 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  34.78 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  33 
 
 
344 aa  43.1  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.65 
 
 
368 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>