30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0186 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  685    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  71.92 
 
 
356 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  68 
 
 
352 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  50.29 
 
 
354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  45.76 
 
 
367 aa  318  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  46.91 
 
 
361 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  47.34 
 
 
363 aa  281  9e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  47.84 
 
 
349 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  46.02 
 
 
365 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  44.63 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  49.24 
 
 
361 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  45.68 
 
 
368 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  45.54 
 
 
360 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  43.39 
 
 
353 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  42.65 
 
 
356 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  42.07 
 
 
337 aa  238  9e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  43.4 
 
 
362 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  39.81 
 
 
369 aa  231  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  37.54 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  37.57 
 
 
357 aa  202  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  35.82 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  34.14 
 
 
353 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  41.64 
 
 
366 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  34.74 
 
 
345 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  30.16 
 
 
151 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  30.6 
 
 
151 aa  49.7  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  29.37 
 
 
151 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  29.37 
 
 
151 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 
138 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>