More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2085 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  84.21 
 
 		 199 aa  326  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  57.98 
 
 		 221 aa  237  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  57.98 
 
 		 221 aa  237  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  57.98 
 
 		 221 aa  237  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  58.15 
 
 		 192 aa  229  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  55.98 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  55.98 
 
 		 225 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  58.79 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  47.67 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  52.33 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  50.57 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  47.67 
 
 		 189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  45.83 
 
 		 201 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  46.82 
 
 		 218 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  48.26 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  45.78 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  44.65 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.26 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33.53 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 175 aa  94.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  35.43 
 
 		 178 aa  91.3  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  31.32 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  37.06 
 
 		 181 aa  88.2  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  35.06 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  35.06 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  35.06 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  35.06 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  35.06 
 
 		 175 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  32.39 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  32.39 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  34.81 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  34.15 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  32.39 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  32.39 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  32.39 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  32.39 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  31.71 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  32.78 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  32.18 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  32.54 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  46 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  33.16 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  34.5 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.94 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  40.51 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 		 102 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  42.7 
 
 		 389 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  43.33 
 
 		 116 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 97 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  42.17 
 
 		 113 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 135 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  38.4 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  41.05 
 
 		 711 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1579  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  35.42 
 
 		 566 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.22 
 
 		 563 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000959863  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36.27 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  37.63 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 99 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  41.86 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.74 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  34 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  44.33 
 
 		 703 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  44.57 
 
 		 703 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  37.63 
 
 		 711 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  36.05 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  39.81 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.89 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2254  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.56 
 
 		 564 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2878  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 113 aa  62  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 		 558 aa  62  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.12 
 
 		 141 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.08 
 
 		 392 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 		 141 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  38.18 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  38.71 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  43.82 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  46.75 
 
 		 560 aa  61.2  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  40.78 
 
 		 820 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  32.56 
 
 		 119 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>