More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0893 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  87.48 
 
 
711 aa  1254    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  58.71 
 
 
703 aa  776    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  55.46 
 
 
703 aa  734    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  100 
 
 
711 aa  1415    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  40.24 
 
 
603 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  38.5 
 
 
626 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  37.3 
 
 
608 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  39.06 
 
 
577 aa  365  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  40.11 
 
 
620 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  37.21 
 
 
603 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  37.87 
 
 
584 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  37.02 
 
 
599 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  38.64 
 
 
730 aa  340  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  36.84 
 
 
588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  33.21 
 
 
580 aa  320  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  37.21 
 
 
584 aa  316  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  32.97 
 
 
573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  37.61 
 
 
590 aa  303  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  40.79 
 
 
522 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  37.2 
 
 
620 aa  302  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  35.53 
 
 
729 aa  293  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  38.15 
 
 
584 aa  293  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  38.99 
 
 
521 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  39.03 
 
 
521 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  33.69 
 
 
574 aa  277  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  37.44 
 
 
601 aa  276  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  38.99 
 
 
521 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  40 
 
 
546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33.98 
 
 
558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  34.48 
 
 
578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.77 
 
 
588 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  33.68 
 
 
591 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  37.35 
 
 
522 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  37.83 
 
 
522 aa  260  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  31.76 
 
 
590 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  30.18 
 
 
585 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  32.02 
 
 
588 aa  256  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  39.03 
 
 
521 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.22 
 
 
571 aa  248  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  31.68 
 
 
572 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  31.6 
 
 
605 aa  247  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  35.19 
 
 
571 aa  246  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  32.09 
 
 
586 aa  243  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  35.6 
 
 
517 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  30.04 
 
 
586 aa  241  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  29.01 
 
 
587 aa  239  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30 
 
 
585 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  28.09 
 
 
574 aa  235  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  30.12 
 
 
581 aa  233  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  30.07 
 
 
605 aa  233  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  34.95 
 
 
517 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  32.68 
 
 
592 aa  231  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  29.86 
 
 
583 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  28.84 
 
 
583 aa  228  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  38.43 
 
 
698 aa  227  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  31.5 
 
 
604 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  28.96 
 
 
587 aa  221  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  29.69 
 
 
571 aa  220  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  28.75 
 
 
597 aa  218  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  27.48 
 
 
574 aa  213  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  29.18 
 
 
580 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  28.99 
 
 
580 aa  211  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  30 
 
 
596 aa  206  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  29.46 
 
 
560 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  29.13 
 
 
575 aa  203  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.21 
 
 
570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.52 
 
 
579 aa  198  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  28.23 
 
 
570 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  28.39 
 
 
606 aa  197  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2470  sulphate transporter  33.52 
 
 
706 aa  196  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.760506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  28.39 
 
 
570 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  29.02 
 
 
563 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  27.59 
 
 
570 aa  195  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  25.52 
 
 
552 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  29.16 
 
 
588 aa  194  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  28.26 
 
 
558 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  35.1 
 
 
690 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  27.49 
 
 
582 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  27.95 
 
 
584 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  28.71 
 
 
575 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  26.96 
 
 
569 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  26.79 
 
 
569 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  27.88 
 
 
559 aa  191  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  27.54 
 
 
553 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  32.58 
 
 
552 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  26.02 
 
 
552 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  30.78 
 
 
582 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  26.4 
 
 
568 aa  189  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  28.15 
 
 
556 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  27.04 
 
 
568 aa  188  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  30.04 
 
 
572 aa  188  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  27.49 
 
 
551 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  25 
 
 
567 aa  187  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  28.09 
 
 
580 aa  187  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  27.24 
 
 
552 aa  187  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  29.18 
 
 
571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  26.31 
 
 
586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  30.23 
 
 
577 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  30.77 
 
 
557 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  27.69 
 
 
568 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>