More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2515 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  56.08 
 
 		 571 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  100 
 
 		 578 aa  1142    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  83.57 
 
 		 588 aa  939    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  61.48 
 
 		 574 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  62.06 
 
 		 592 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  56.33 
 
 		 583 aa  608  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  56.07 
 
 		 605 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  50.09 
 
 		 574 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  51.79 
 
 		 586 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  54.72 
 
 		 582 aa  492  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  47.6 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  45.57 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  47.07 
 
 		 585 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  44.7 
 
 		 573 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  37.7 
 
 		 597 aa  364  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  39.96 
 
 		 590 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  37.92 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  37.99 
 
 		 572 aa  330  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  37.85 
 
 		 570 aa  326  7e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  39.72 
 
 		 591 aa  319  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  39.17 
 
 		 558 aa  319  9e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  37.1 
 
 		 588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  34.26 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  32.07 
 
 		 626 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  33.03 
 
 		 581 aa  266  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  32.85 
 
 		 711 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  36.07 
 
 		 584 aa  263  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  29.96 
 
 		 573 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  30.77 
 
 		 608 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  32.98 
 
 		 580 aa  257  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  32.15 
 
 		 603 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  32.43 
 
 		 560 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  32.52 
 
 		 620 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  34.19 
 
 		 571 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  33.03 
 
 		 711 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  32.04 
 
 		 584 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  34.02 
 
 		 584 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  33.15 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  36.43 
 
 		 571 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  28.62 
 
 		 569 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  28.62 
 
 		 569 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  31.52 
 
 		 703 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  31.72 
 
 		 703 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  29.8 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  30.22 
 
 		 579 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  34.17 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  31.45 
 
 		 580 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  30.84 
 
 		 574 aa  236  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  31.08 
 
 		 575 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  29.93 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  32.41 
 
 		 521 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  32.66 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  29.82 
 
 		 596 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  29.91 
 
 		 568 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  30.53 
 
 		 603 aa  229  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  34.26 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  30.22 
 
 		 595 aa  227  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  31.27 
 
 		 586 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  31.5 
 
 		 521 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  30.72 
 
 		 574 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  29.23 
 
 		 568 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  30.7 
 
 		 573 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  29.06 
 
 		 568 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  32.11 
 
 		 522 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  33.92 
 
 		 559 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  29.65 
 
 		 578 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  31.95 
 
 		 521 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  29.86 
 
 		 573 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  33.21 
 
 		 590 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  32.11 
 
 		 556 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  31.69 
 
 		 522 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  31.23 
 
 		 599 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  28.96 
 
 		 575 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  30.34 
 
 		 582 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  28.67 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  33.27 
 
 		 557 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  28.7 
 
 		 570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  30 
 
 		 571 aa  213  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  30.88 
 
 		 546 aa  213  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  30.22 
 
 		 576 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  31.89 
 
 		 583 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  34.14 
 
 		 569 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  31.29 
 
 		 563 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  29.91 
 
 		 565 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  31.58 
 
 		 556 aa  210  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  31.95 
 
 		 551 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  30.05 
 
 		 565 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  29.19 
 
 		 590 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  31.07 
 
 		 572 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  30.71 
 
 		 580 aa  207  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  30.53 
 
 		 580 aa  206  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  27.97 
 
 		 570 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  28.11 
 
 		 585 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  33.7 
 
 		 573 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  29.74 
 
 		 576 aa  204  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  28.78 
 
 		 585 aa  203  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  31.03 
 
 		 587 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  30.18 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  28.78 
 
 		 585 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  29.89 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>