More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0718 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  98.77 
 
 		 570 aa  1123    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  71.66 
 
 		 595 aa  800    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  100 
 
 		 570 aa  1135    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  89.98 
 
 		 573 aa  1016    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  95.96 
 
 		 570 aa  1056    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  60.43 
 
 		 580 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  76.47 
 
 		 583 aa  866    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  64 
 
 		 596 aa  717    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  72.37 
 
 		 586 aa  793    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  75.36 
 
 		 579 aa  847    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  53.04 
 
 		 590 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  50.54 
 
 		 582 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  49.64 
 
 		 575 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  50.71 
 
 		 592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  50.62 
 
 		 590 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  48.23 
 
 		 585 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  46.41 
 
 		 605 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  50.53 
 
 		 581 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.49 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.49 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  45.57 
 
 		 576 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  47.29 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  41.56 
 
 		 563 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  40.14 
 
 		 578 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  38.55 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  40.18 
 
 		 574 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  38.66 
 
 		 575 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5808  sulphate transporter  51.46 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125757  normal  0.376579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  40.69 
 
 		 573 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  37.68 
 
 		 568 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  37.5 
 
 		 568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  37.5 
 
 		 568 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  34.53 
 
 		 565 aa  337  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  35.12 
 
 		 588 aa  306  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  38.81 
 
 		 571 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  34.81 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  35.37 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  35.45 
 
 		 590 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  38.07 
 
 		 587 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  35.07 
 
 		 585 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  34.75 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  34.56 
 
 		 585 aa  296  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  37.21 
 
 		 569 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  34.6 
 
 		 574 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  33.83 
 
 		 591 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  32.49 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  34.41 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  32.31 
 
 		 569 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  34.36 
 
 		 585 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  34.36 
 
 		 585 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  34.36 
 
 		 585 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  34.36 
 
 		 585 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  33.15 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  33.15 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  34.94 
 
 		 576 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  34.01 
 
 		 569 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  35.09 
 
 		 556 aa  282  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  34.1 
 
 		 592 aa  281  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.83 
 
 		 572 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.34 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  35.16 
 
 		 559 aa  273  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  36.48 
 
 		 591 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.16 
 
 		 585 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  31.27 
 
 		 574 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  34.66 
 
 		 600 aa  270  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.81 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  34.28 
 
 		 567 aa  266  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  33.27 
 
 		 578 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  33.4 
 
 		 592 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  32.91 
 
 		 605 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  30.36 
 
 		 571 aa  259  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  31.76 
 
 		 583 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  35.66 
 
 		 583 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.1 
 
 		 590 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.33 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.85 
 
 		 592 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  30.34 
 
 		 575 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  30.04 
 
 		 570 aa  236  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  27.73 
 
 		 588 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30.4 
 
 		 585 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  29.66 
 
 		 570 aa  234  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  29.6 
 
 		 597 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  33.15 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  28.52 
 
 		 565 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  28.7 
 
 		 578 aa  230  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  31.4 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  29.06 
 
 		 567 aa  226  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  32.71 
 
 		 558 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  29.81 
 
 		 573 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.16 
 
 		 576 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  35.02 
 
 		 573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  30.5 
 
 		 557 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  32.34 
 
 		 558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  30.29 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  29.95 
 
 		 576 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>