More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1916 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  60.61 
 
 
570 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  60.43 
 
 
570 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  61.03 
 
 
573 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  63.77 
 
 
583 aa  705    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  60.61 
 
 
570 aa  673    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  62.82 
 
 
579 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  61.81 
 
 
586 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  63.06 
 
 
595 aa  706    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  69.77 
 
 
596 aa  791    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  100 
 
 
580 aa  1138    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  56.89 
 
 
590 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  53.43 
 
 
590 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  52.47 
 
 
592 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  51.48 
 
 
605 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  50.79 
 
 
575 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  51.69 
 
 
582 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  51.66 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  51.66 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  51.66 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  51.49 
 
 
610 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  51.66 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  51.66 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  51.66 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  53.37 
 
 
581 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  50.09 
 
 
585 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  46.89 
 
 
563 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  46.57 
 
 
576 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  48.9 
 
 
576 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  41.23 
 
 
560 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5808  sulphate transporter  52.62 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125757  normal  0.376579 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  40.71 
 
 
574 aa  369  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  37.79 
 
 
568 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  38.41 
 
 
578 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  37.79 
 
 
568 aa  359  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  37.25 
 
 
568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  36.66 
 
 
575 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  37.99 
 
 
573 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  36.15 
 
 
565 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  39.19 
 
 
587 aa  329  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  39.14 
 
 
566 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  37.73 
 
 
559 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  35.56 
 
 
588 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  37.02 
 
 
556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  39.67 
 
 
569 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  33.45 
 
 
569 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  33.45 
 
 
569 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  34.4 
 
 
584 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  35.33 
 
 
572 aa  299  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  33.69 
 
 
588 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  34.77 
 
 
569 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  37.73 
 
 
571 aa  290  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  34.23 
 
 
585 aa  286  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  32.81 
 
 
574 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  34.62 
 
 
585 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  34.23 
 
 
585 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  33.77 
 
 
592 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  33.63 
 
 
585 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  34.04 
 
 
585 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  34.1 
 
 
590 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  35.06 
 
 
574 aa  280  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  38.95 
 
 
591 aa  280  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  32.22 
 
 
591 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  32.54 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  32.54 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  35.26 
 
 
576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  32.54 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  32.54 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  32.6 
 
 
567 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  32.76 
 
 
579 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  32.76 
 
 
579 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  30.12 
 
 
571 aa  264  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  32.38 
 
 
600 aa  260  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.43 
 
 
590 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  31.86 
 
 
578 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.98 
 
 
574 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  32.98 
 
 
578 aa  257  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  32.5 
 
 
592 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.27 
 
 
586 aa  256  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  30.85 
 
 
588 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  35.54 
 
 
583 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  33.51 
 
 
585 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  32.98 
 
 
605 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  32.04 
 
 
583 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.48 
 
 
592 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  33.91 
 
 
576 aa  247  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  30.76 
 
 
575 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  34.53 
 
 
573 aa  239  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  37.27 
 
 
570 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  32.55 
 
 
550 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  34.15 
 
 
558 aa  233  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  28.77 
 
 
573 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  29.42 
 
 
566 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  33.27 
 
 
588 aa  220  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  28.52 
 
 
567 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  31.31 
 
 
558 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  33.27 
 
 
570 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  33.27 
 
 
570 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.27 
 
 
570 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  33.27 
 
 
570 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  33.27 
 
 
570 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>