More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3374 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  71.66 
 
 		 570 aa  790    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  71.84 
 
 		 570 aa  795    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  100 
 
 		 595 aa  1170    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  73.62 
 
 		 573 aa  821    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  72.85 
 
 		 583 aa  833    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  63.06 
 
 		 580 aa  718    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  63.62 
 
 		 596 aa  726    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  68.39 
 
 		 586 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  71.48 
 
 		 570 aa  790    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  71.61 
 
 		 579 aa  778    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  54.92 
 
 		 590 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  50.87 
 
 		 590 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  50.86 
 
 		 582 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  50.35 
 
 		 592 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  49.56 
 
 		 605 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  48.42 
 
 		 575 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  50.36 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  48.33 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  48.51 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  48.51 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  48.51 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  48.33 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  48.51 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  48.51 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  50.54 
 
 		 581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  45.16 
 
 		 576 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  44.68 
 
 		 563 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  45.82 
 
 		 576 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5808  sulphate transporter  54.14 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125757  normal  0.376579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  40.21 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  38.18 
 
 		 560 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  40.14 
 
 		 574 aa  359  7e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  41.02 
 
 		 573 aa  359  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  38.98 
 
 		 568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  38.71 
 
 		 575 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  38.98 
 
 		 568 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  39.56 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  35.07 
 
 		 565 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  37.52 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  34.84 
 
 		 585 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  34.23 
 
 		 585 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  33.93 
 
 		 584 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  34.21 
 
 		 590 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  34.48 
 
 		 585 aa  300  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  34.48 
 
 		 585 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  36.84 
 
 		 587 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  33.75 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  35.48 
 
 		 588 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  33.75 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  33.75 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  33.75 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  38.4 
 
 		 571 aa  296  9e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  37.73 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  36.61 
 
 		 574 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  35.67 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  35.67 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  36.26 
 
 		 569 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  37.45 
 
 		 556 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  39.03 
 
 		 569 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  34.35 
 
 		 592 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  38.65 
 
 		 591 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  33.46 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  31.17 
 
 		 591 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  32.68 
 
 		 567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  33.21 
 
 		 578 aa  273  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.93 
 
 		 588 aa  273  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  31.14 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  31.14 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.64 
 
 		 572 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  34.64 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  33.21 
 
 		 600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  33.65 
 
 		 592 aa  270  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.66 
 
 		 585 aa  267  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  33.09 
 
 		 592 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  31.18 
 
 		 571 aa  251  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  33.33 
 
 		 605 aa  250  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  30.07 
 
 		 588 aa  250  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  33.9 
 
 		 590 aa  249  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  33.33 
 
 		 570 aa  249  8e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  32.96 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  30.29 
 
 		 574 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  32.86 
 
 		 586 aa  247  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  36.24 
 
 		 583 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  30.51 
 
 		 575 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  31.83 
 
 		 583 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  30.22 
 
 		 578 aa  241  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  32.4 
 
 		 585 aa  236  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  30.2 
 
 		 597 aa  236  6e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  35.83 
 
 		 573 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.49 
 
 		 576 aa  226  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  33.15 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  29.71 
 
 		 565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  31.88 
 
 		 558 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  32.11 
 
 		 557 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  29.17 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  30.39 
 
 		 572 aa  213  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  32.47 
 
 		 558 aa  211  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  31.05 
 
 		 565 aa  210  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  32.79 
 
 		 588 aa  210  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  30.68 
 
 		 556 aa  209  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>