More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2574 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  100 
 
 
591 aa  1135    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  45.7 
 
 
572 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  43.71 
 
 
590 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  41.95 
 
 
585 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  40.07 
 
 
588 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  41.95 
 
 
585 aa  382  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  43.92 
 
 
588 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  39.89 
 
 
578 aa  365  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  40.25 
 
 
583 aa  360  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  40.57 
 
 
574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  37.73 
 
 
571 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  41.7 
 
 
586 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  43.39 
 
 
558 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  37.5 
 
 
588 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  34.64 
 
 
574 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  38.78 
 
 
560 aa  336  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  40.11 
 
 
605 aa  336  9e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  42.34 
 
 
584 aa  333  6e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  38.95 
 
 
580 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  37.72 
 
 
592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  37.81 
 
 
568 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  36.2 
 
 
568 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  37.9 
 
 
579 aa  323  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  37.81 
 
 
568 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  36.75 
 
 
569 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  36.75 
 
 
569 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  34.09 
 
 
711 aa  321  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  37.04 
 
 
583 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  32.55 
 
 
608 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  33.51 
 
 
603 aa  313  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  38.65 
 
 
595 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  36.72 
 
 
574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  36.31 
 
 
586 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  37.46 
 
 
573 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  36.33 
 
 
578 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  41.13 
 
 
571 aa  309  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  39.63 
 
 
571 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  35.85 
 
 
577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  33.52 
 
 
626 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  36.28 
 
 
581 aa  307  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  35.39 
 
 
565 aa  306  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  37.28 
 
 
570 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  37.68 
 
 
575 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  36.76 
 
 
572 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  35.45 
 
 
584 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  37.11 
 
 
576 aa  299  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  35.24 
 
 
597 aa  298  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  34.81 
 
 
570 aa  297  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  37.3 
 
 
582 aa  297  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  36.48 
 
 
570 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  36.52 
 
 
573 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  34.04 
 
 
573 aa  296  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  36.65 
 
 
570 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  35.85 
 
 
596 aa  296  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  35.14 
 
 
565 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  34.84 
 
 
570 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  33.94 
 
 
620 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  36.43 
 
 
590 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  34.96 
 
 
588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  36.52 
 
 
586 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  36.6 
 
 
605 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  36.33 
 
 
603 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  36.53 
 
 
522 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  37.5 
 
 
575 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  33.33 
 
 
711 aa  280  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  36.78 
 
 
582 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  36.49 
 
 
592 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  36.86 
 
 
590 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  35.47 
 
 
730 aa  273  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  34.94 
 
 
576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  32.14 
 
 
584 aa  269  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  36.62 
 
 
522 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  32.27 
 
 
591 aa  269  8.999999999999999e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  38.55 
 
 
571 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  36.78 
 
 
556 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  37.98 
 
 
566 aa  267  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  31.88 
 
 
703 aa  267  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  35.51 
 
 
576 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  32.63 
 
 
703 aa  264  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  37.11 
 
 
574 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  37.94 
 
 
559 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  31.4 
 
 
585 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  31.4 
 
 
585 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  31.4 
 
 
585 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  31.4 
 
 
585 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  34.04 
 
 
592 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  35.05 
 
 
585 aa  262  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  35.86 
 
 
522 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  30.24 
 
 
585 aa  260  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  34.63 
 
 
599 aa  261  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.2 
 
 
610 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.2 
 
 
610 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  34.25 
 
 
599 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  35.73 
 
 
546 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  34.27 
 
 
517 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  34.27 
 
 
521 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  36.03 
 
 
610 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  30.34 
 
 
585 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  30.34 
 
 
585 aa  257  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  30.34 
 
 
585 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>