More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2232 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  67.96 
 
 
570 aa  746    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  68.62 
 
 
570 aa  752    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  100 
 
 
597 aa  1190    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  38.87 
 
 
574 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  38.11 
 
 
571 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  39.02 
 
 
574 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  37.95 
 
 
578 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  38.04 
 
 
588 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  37.8 
 
 
592 aa  352  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  38.52 
 
 
586 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  38.6 
 
 
605 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  36.64 
 
 
585 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  37.06 
 
 
573 aa  339  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  37.22 
 
 
585 aa  331  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  36.03 
 
 
588 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  35.85 
 
 
583 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  35.05 
 
 
572 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  35.15 
 
 
582 aa  294  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.92 
 
 
590 aa  293  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.7 
 
 
591 aa  277  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  34.1 
 
 
588 aa  263  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  30.66 
 
 
569 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  30.66 
 
 
569 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  30.7 
 
 
573 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  29.6 
 
 
560 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  30.53 
 
 
595 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  29.93 
 
 
570 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  32.59 
 
 
584 aa  234  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33.21 
 
 
558 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  29.6 
 
 
570 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  29.42 
 
 
570 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  28.22 
 
 
583 aa  230  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  32.2 
 
 
581 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  28.85 
 
 
703 aa  229  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  28.26 
 
 
711 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  31.19 
 
 
588 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  30.03 
 
 
576 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  28.89 
 
 
579 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  30.02 
 
 
584 aa  223  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  28.67 
 
 
580 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  28.57 
 
 
711 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  31.15 
 
 
571 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  29.15 
 
 
565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  29.05 
 
 
626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  28.98 
 
 
703 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  31.65 
 
 
582 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  27.72 
 
 
586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  28.77 
 
 
577 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  29.93 
 
 
563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  29.16 
 
 
575 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  28.62 
 
 
584 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  27.46 
 
 
603 aa  213  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  29.08 
 
 
590 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  29.31 
 
 
557 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  29.05 
 
 
603 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  26.96 
 
 
608 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  27.99 
 
 
596 aa  204  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  31.43 
 
 
556 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  27.42 
 
 
586 aa  202  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  28.73 
 
 
574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  28.4 
 
 
565 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  28.99 
 
 
517 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  31.41 
 
 
556 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  30.11 
 
 
620 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  28.19 
 
 
576 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  27.96 
 
 
578 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  30.84 
 
 
576 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  26.91 
 
 
568 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  30.59 
 
 
551 aa  194  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  27.09 
 
 
568 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  26.91 
 
 
568 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  28.83 
 
 
571 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  34.35 
 
 
690 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  29.05 
 
 
599 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  28.44 
 
 
592 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  29.62 
 
 
583 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  30.97 
 
 
571 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  31.79 
 
 
573 aa  189  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  29.41 
 
 
517 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  29.04 
 
 
576 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  28.65 
 
 
574 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  30.17 
 
 
620 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  30.88 
 
 
556 aa  186  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  27.22 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  28.42 
 
 
599 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  28.01 
 
 
590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  28.67 
 
 
572 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  27.72 
 
 
559 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  29.89 
 
 
546 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  30.13 
 
 
566 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  26.22 
 
 
585 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  28.86 
 
 
569 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  31.2 
 
 
698 aa  180  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  29.5 
 
 
581 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  28.17 
 
 
575 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  28.31 
 
 
580 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  29.3 
 
 
556 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  28.31 
 
 
580 aa  178  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  26.85 
 
 
575 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  29.78 
 
 
730 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>