More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1188 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  87.44 
 
 		 599 aa  1004    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  62.37 
 
 		 620 aa  653    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  100 
 
 		 603 aa  1199    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  61.6 
 
 		 601 aa  567  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  58.85 
 
 		 584 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  43.13 
 
 		 608 aa  485  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  43.03 
 
 		 603 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  42.81 
 
 		 626 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  63.16 
 
 		 698 aa  465  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  43.73 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  43.05 
 
 		 620 aa  442  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  44.03 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  37.57 
 
 		 711 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  37.02 
 
 		 703 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  37.15 
 
 		 711 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  39.44 
 
 		 521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  40.15 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  40.61 
 
 		 546 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  40.15 
 
 		 521 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  39.51 
 
 		 521 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  35.48 
 
 		 703 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  38.62 
 
 		 522 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  39.77 
 
 		 517 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  39.77 
 
 		 521 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  37.45 
 
 		 522 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  39.81 
 
 		 517 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  34.62 
 
 		 730 aa  287  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  30.91 
 
 		 580 aa  279  8e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  31.98 
 
 		 573 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  37.86 
 
 		 584 aa  276  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  34.93 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  35.39 
 
 		 729 aa  259  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.64 
 
 		 585 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  34.71 
 
 		 590 aa  257  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  36.33 
 
 		 591 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.65 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  30.84 
 
 		 605 aa  246  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  32.99 
 
 		 586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  31.43 
 
 		 585 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  30.53 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  32.26 
 
 		 604 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  32.42 
 
 		 558 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  27.62 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  30.07 
 
 		 574 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  29.12 
 
 		 588 aa  228  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  27.58 
 
 		 587 aa  226  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  30.77 
 
 		 590 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  32.34 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  27.64 
 
 		 583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  32.84 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  30.3 
 
 		 572 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  29.42 
 
 		 592 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  25.35 
 
 		 574 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  27.07 
 
 		 587 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  29.49 
 
 		 606 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  31.99 
 
 		 581 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  31.24 
 
 		 586 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  30.37 
 
 		 583 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  27.59 
 
 		 569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  30.12 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  27.77 
 
 		 569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  29.53 
 
 		 563 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  30.89 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  31.54 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  29.35 
 
 		 597 aa  194  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  26.8 
 
 		 570 aa  194  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  27.99 
 
 		 578 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  27.64 
 
 		 566 aa  193  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  30.62 
 
 		 560 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  26.49 
 
 		 567 aa  190  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  27.87 
 
 		 553 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  31.18 
 
 		 571 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  26.49 
 
 		 568 aa  187  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  26.13 
 
 		 568 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  28.25 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  33.58 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  29.56 
 
 		 568 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  26.48 
 
 		 552 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  28.24 
 
 		 573 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  29.26 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  29.26 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  26.02 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  29.69 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  30.94 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  35.15 
 
 		 690 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  28.21 
 
 		 565 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  27.61 
 
 		 604 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  29.51 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  28.32 
 
 		 570 aa  180  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  28.54 
 
 		 560 aa  179  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  27.17 
 
 		 552 aa  178  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  28.75 
 
 		 575 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  30.05 
 
 		 571 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  30.77 
 
 		 570 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  30.89 
 
 		 577 aa  177  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  29.87 
 
 		 554 aa  176  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  27.74 
 
 		 570 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2640  high affinity sulfate transporter (SulP)  33.64 
 
 		 703 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  26.8 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  27.23 
 
 		 582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>