More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0091 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  96.93 
 
 		 521 aa  873    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  96.35 
 
 		 521 aa  919    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  75.58 
 
 		 522 aa  729    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  76.36 
 
 		 522 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  78.64 
 
 		 522 aa  774    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  93.09 
 
 		 521 aa  898    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  100 
 
 		 521 aa  1020    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  66.47 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  59.05 
 
 		 517 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  58.99 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  43.58 
 
 		 626 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  44.36 
 
 		 577 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  41.59 
 
 		 603 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  41.54 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  40.9 
 
 		 620 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  38.33 
 
 		 608 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  40.19 
 
 		 603 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  41.19 
 
 		 711 aa  333  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  40.15 
 
 		 599 aa  326  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  38.39 
 
 		 730 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  36.79 
 
 		 620 aa  286  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  36.15 
 
 		 703 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  38.79 
 
 		 711 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  35.89 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  37.76 
 
 		 590 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  37.25 
 
 		 729 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  34.07 
 
 		 588 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  30.53 
 
 		 580 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  40.3 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  41.19 
 
 		 698 aa  262  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  32.81 
 
 		 703 aa  256  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  35.9 
 
 		 584 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  30.09 
 
 		 573 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  32.42 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  33.7 
 
 		 585 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  31.74 
 
 		 588 aa  247  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  40.77 
 
 		 584 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.71 
 
 		 591 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  33.03 
 
 		 583 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33.6 
 
 		 558 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  34.41 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.2 
 
 		 574 aa  226  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.05 
 
 		 574 aa  226  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  32.85 
 
 		 605 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  32.79 
 
 		 592 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.46 
 
 		 572 aa  216  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.29 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.94 
 
 		 571 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  31.73 
 
 		 585 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  30.11 
 
 		 605 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  29.39 
 
 		 575 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  29.6 
 
 		 573 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  31.59 
 
 		 586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  30.11 
 
 		 577 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  31.11 
 
 		 604 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  30.11 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  29.38 
 
 		 585 aa  193  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  28.82 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  31.33 
 
 		 545 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  32.71 
 
 		 573 aa  190  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  27.27 
 
 		 579 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  29.77 
 
 		 563 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  25.76 
 
 		 570 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  29.38 
 
 		 585 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  31.14 
 
 		 544 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  28.73 
 
 		 572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  28.05 
 
 		 581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  29.15 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  29.15 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  31.91 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  30.84 
 
 		 592 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  29.15 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  29.15 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  28.87 
 
 		 590 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  28.89 
 
 		 555 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  31.53 
 
 		 549 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  29.15 
 
 		 585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  31.09 
 
 		 632 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  29.38 
 
 		 585 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  27.61 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  26.5 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  26.5 
 
 		 569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  28.76 
 
 		 563 aa  180  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  29.13 
 
 		 574 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  27.96 
 
 		 587 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  26.59 
 
 		 550 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  30.48 
 
 		 580 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  26.26 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  33.89 
 
 		 571 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  27.03 
 
 		 606 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.06 
 
 		 584 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  28.95 
 
 		 576 aa  178  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  27.88 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  33.1 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  29.98 
 
 		 581 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1320  sulfate permease  41.94 
 
 		 694 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  30.93 
 
 		 588 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  28.03 
 
 		 568 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  29.77 
 
 		 571 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  27.04 
 
 		 600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>