More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1102 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  100 
 
 
584 aa  1165    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  46.78 
 
 
626 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  47.69 
 
 
603 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  46.81 
 
 
577 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  46.88 
 
 
620 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  42.62 
 
 
608 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  44.03 
 
 
603 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  43.76 
 
 
599 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  42.16 
 
 
620 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  40.48 
 
 
522 aa  360  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.05 
 
 
711 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  40.81 
 
 
521 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  40.42 
 
 
517 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  41.36 
 
 
546 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  42.05 
 
 
601 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  41.34 
 
 
521 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  40.99 
 
 
517 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  40 
 
 
522 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  40.81 
 
 
521 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  40.19 
 
 
522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  36.85 
 
 
730 aa  333  6e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  34.57 
 
 
580 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  43.92 
 
 
584 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  35.69 
 
 
703 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  35.77 
 
 
703 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  41.18 
 
 
521 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  37.52 
 
 
711 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  33.04 
 
 
573 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  36.03 
 
 
584 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  33.98 
 
 
729 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  34.43 
 
 
590 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  30.39 
 
 
588 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.36 
 
 
585 aa  269  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  33.21 
 
 
588 aa  267  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  43.81 
 
 
698 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.33 
 
 
588 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  33.94 
 
 
605 aa  251  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  32.04 
 
 
578 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  32.43 
 
 
586 aa  247  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  32.94 
 
 
558 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  31.29 
 
 
581 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  30.91 
 
 
586 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  31.69 
 
 
585 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  32.14 
 
 
591 aa  238  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  31.19 
 
 
604 aa  237  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  30.85 
 
 
592 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  30.19 
 
 
605 aa  234  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  30.59 
 
 
574 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  27.95 
 
 
571 aa  230  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  33.27 
 
 
590 aa  230  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  29.87 
 
 
583 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  27.1 
 
 
587 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  30.23 
 
 
572 aa  220  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  27.23 
 
 
574 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  33.97 
 
 
571 aa  217  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  30.32 
 
 
560 aa  211  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  30.46 
 
 
579 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  29.85 
 
 
567 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  29.85 
 
 
567 aa  207  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  26.1 
 
 
552 aa  207  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29 
 
 
579 aa  206  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  30.54 
 
 
575 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  29.59 
 
 
571 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  29.64 
 
 
588 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  27.27 
 
 
587 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  30.34 
 
 
551 aa  203  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  29.33 
 
 
597 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  27.9 
 
 
568 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  29.03 
 
 
574 aa  200  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  26.93 
 
 
569 aa  200  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  28.91 
 
 
577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  28.11 
 
 
573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  26.75 
 
 
569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  28.27 
 
 
578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  30.8 
 
 
572 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  25.04 
 
 
583 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  30.43 
 
 
584 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  28.86 
 
 
586 aa  196  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  26.1 
 
 
552 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  27.86 
 
 
570 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  31.27 
 
 
555 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  28.11 
 
 
574 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  29.87 
 
 
581 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  28.21 
 
 
583 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  28.15 
 
 
553 aa  193  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  26 
 
 
552 aa  193  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  28.7 
 
 
583 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  33.08 
 
 
573 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  30.6 
 
 
575 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  28.57 
 
 
563 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  29.29 
 
 
582 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  28.76 
 
 
595 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  27.76 
 
 
565 aa  190  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  29.91 
 
 
571 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  31.14 
 
 
552 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.82 
 
 
570 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  29.42 
 
 
588 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  30.46 
 
 
581 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  29.13 
 
 
604 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  29 
 
 
596 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>