More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1995 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  60.25 
 
 
580 aa  696    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  100 
 
 
573 aa  1141    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  40.37 
 
 
730 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  39.57 
 
 
590 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  36.48 
 
 
626 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  33.82 
 
 
711 aa  334  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  35.68 
 
 
620 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  35.39 
 
 
603 aa  332  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  35.54 
 
 
729 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  34.27 
 
 
605 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  34.18 
 
 
703 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  35.13 
 
 
608 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  33.04 
 
 
584 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  35.97 
 
 
577 aa  309  9e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  32.61 
 
 
711 aa  289  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  33.27 
 
 
604 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  32.85 
 
 
703 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  35.2 
 
 
584 aa  277  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  31.19 
 
 
603 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.6 
 
 
588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  32.56 
 
 
588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  33.15 
 
 
522 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  30.98 
 
 
517 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  29.96 
 
 
578 aa  264  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  31.71 
 
 
599 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  28.95 
 
 
585 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  32.44 
 
 
550 aa  258  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  33.58 
 
 
575 aa  257  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.92 
 
 
571 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  30.5 
 
 
605 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.95 
 
 
574 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  29.69 
 
 
574 aa  253  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  30.27 
 
 
588 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  30.88 
 
 
522 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  32.26 
 
 
546 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  30.77 
 
 
522 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  30.46 
 
 
587 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  29.58 
 
 
586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  30.02 
 
 
568 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  32.83 
 
 
572 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  32.96 
 
 
583 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  33.15 
 
 
577 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  28.25 
 
 
583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  30.3 
 
 
521 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  31.74 
 
 
555 aa  239  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  30.48 
 
 
517 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  29.7 
 
 
567 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  31.16 
 
 
558 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  33.14 
 
 
581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  27.83 
 
 
606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.54 
 
 
579 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  30.55 
 
 
521 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  29.34 
 
 
567 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  31.33 
 
 
545 aa  232  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  27.85 
 
 
570 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  28.19 
 
 
585 aa  230  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  27.9 
 
 
553 aa  230  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  29.15 
 
 
568 aa  229  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  30.15 
 
 
572 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  28.68 
 
 
568 aa  226  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  30.93 
 
 
521 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  33.02 
 
 
580 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  27.99 
 
 
560 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  29.8 
 
 
590 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  27.92 
 
 
556 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  31.84 
 
 
581 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  29 
 
 
558 aa  224  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  27.52 
 
 
551 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  28.04 
 
 
552 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  29.22 
 
 
583 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  28.86 
 
 
571 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  29.98 
 
 
553 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  30.22 
 
 
587 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  31.96 
 
 
620 aa  223  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  27.4 
 
 
594 aa  223  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  27.42 
 
 
570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  28.62 
 
 
553 aa  219  7e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  27.76 
 
 
568 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  26.35 
 
 
559 aa  219  7.999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  28.55 
 
 
551 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  30.94 
 
 
549 aa  219  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  28.21 
 
 
563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  29.52 
 
 
559 aa  217  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  27.53 
 
 
572 aa  217  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  29.54 
 
 
564 aa  216  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  30.87 
 
 
545 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  27.92 
 
 
563 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  28.55 
 
 
551 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  28.25 
 
 
552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  27.86 
 
 
552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  26.52 
 
 
604 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  26.96 
 
 
592 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  31.83 
 
 
573 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  30.39 
 
 
587 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  29.25 
 
 
560 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  28.54 
 
 
552 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  26.98 
 
 
581 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  29.67 
 
 
591 aa  210  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  29.29 
 
 
601 aa  210  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  31.91 
 
 
632 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>