More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2609 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  100 
 
 
603 aa  1212    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  53.16 
 
 
608 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  51.22 
 
 
577 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  50.25 
 
 
626 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  52.65 
 
 
620 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  47.69 
 
 
584 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  43.03 
 
 
603 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  43.92 
 
 
599 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  39.7 
 
 
711 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  40.78 
 
 
620 aa  382  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  40.03 
 
 
711 aa  379  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  42.96 
 
 
584 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  38.24 
 
 
703 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  39.63 
 
 
522 aa  362  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  41.02 
 
 
521 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  40.85 
 
 
601 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  41.05 
 
 
521 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  38.41 
 
 
703 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  40.64 
 
 
521 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  38.56 
 
 
730 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  36.41 
 
 
584 aa  334  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  38.53 
 
 
517 aa  329  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  39.03 
 
 
522 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  39.02 
 
 
546 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  35.39 
 
 
573 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  38.75 
 
 
522 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  41.24 
 
 
521 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  33.98 
 
 
580 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  35.41 
 
 
588 aa  320  6e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  37.02 
 
 
590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  38.49 
 
 
517 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  35.79 
 
 
698 aa  299  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  31.48 
 
 
585 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.97 
 
 
588 aa  287  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  31.68 
 
 
574 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.68 
 
 
572 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  33.39 
 
 
729 aa  279  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  33.33 
 
 
591 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  33.9 
 
 
558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  32.81 
 
 
586 aa  270  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  30.44 
 
 
587 aa  270  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.93 
 
 
574 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  32.15 
 
 
578 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  31.4 
 
 
588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  32.69 
 
 
605 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30.61 
 
 
585 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  29.56 
 
 
587 aa  247  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  29.26 
 
 
583 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  31.97 
 
 
571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  30.22 
 
 
571 aa  240  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  32.13 
 
 
581 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  31.24 
 
 
583 aa  239  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.88 
 
 
592 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  29.58 
 
 
586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  29.58 
 
 
553 aa  234  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  29.55 
 
 
568 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  29.86 
 
 
590 aa  227  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  30.49 
 
 
588 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  29.8 
 
 
605 aa  223  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  32.56 
 
 
571 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  28.81 
 
 
570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  29.77 
 
 
577 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  27.76 
 
 
569 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  27.58 
 
 
569 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  31.9 
 
 
572 aa  219  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  31.12 
 
 
604 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.6 
 
 
570 aa  217  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  31.72 
 
 
551 aa  217  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  30.33 
 
 
584 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  29.43 
 
 
581 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  26.99 
 
 
552 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  29.77 
 
 
560 aa  213  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  30.68 
 
 
552 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  29.37 
 
 
574 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  27.32 
 
 
552 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  26.71 
 
 
556 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  30.85 
 
 
568 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  30.85 
 
 
568 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  28.09 
 
 
572 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  27.55 
 
 
552 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  31.55 
 
 
575 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  29.91 
 
 
594 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  30.49 
 
 
568 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  28.16 
 
 
550 aa  203  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  31.08 
 
 
555 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  26.18 
 
 
605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  27.54 
 
 
568 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  27.41 
 
 
597 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  25.36 
 
 
545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  29.95 
 
 
583 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  26.64 
 
 
568 aa  200  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  27.95 
 
 
606 aa  200  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  31.65 
 
 
549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  27.72 
 
 
568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  28.18 
 
 
559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  30.06 
 
 
583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  34.17 
 
 
736 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  28.07 
 
 
558 aa  198  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  27.38 
 
 
579 aa  198  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0653  sulphate transporter  32.25 
 
 
708 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.266407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>