More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4885 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  82.45 
 
 
620 aa  687    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  100 
 
 
698 aa  1400    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  63.01 
 
 
603 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  61.3 
 
 
599 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  63.74 
 
 
601 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  47.28 
 
 
584 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  42.89 
 
 
608 aa  340  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  43.54 
 
 
626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  35.36 
 
 
603 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  42.32 
 
 
577 aa  318  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  43.53 
 
 
584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  42.07 
 
 
620 aa  295  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  42.38 
 
 
522 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  40.71 
 
 
521 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  44.1 
 
 
546 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  41.19 
 
 
521 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  40.71 
 
 
522 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  40.66 
 
 
521 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  40.24 
 
 
522 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  37.5 
 
 
711 aa  250  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  40.05 
 
 
517 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  37.47 
 
 
703 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  40.24 
 
 
517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  40.9 
 
 
521 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  37.41 
 
 
730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  33.47 
 
 
573 aa  234  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  37.32 
 
 
703 aa  233  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  37.7 
 
 
711 aa  230  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  35.17 
 
 
605 aa  227  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  33.03 
 
 
729 aa  218  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  31.62 
 
 
580 aa  210  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  36.34 
 
 
604 aa  208  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  34.31 
 
 
585 aa  205  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  36.59 
 
 
590 aa  204  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  35.05 
 
 
558 aa  203  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  33.33 
 
 
588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  35.71 
 
 
588 aa  201  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  37.94 
 
 
584 aa  198  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.16 
 
 
590 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.17 
 
 
572 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  33.02 
 
 
586 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.44 
 
 
571 aa  194  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  31.03 
 
 
578 aa  194  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.55 
 
 
586 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  30.3 
 
 
597 aa  187  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.43 
 
 
591 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  32.88 
 
 
605 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  28.26 
 
 
574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  33.41 
 
 
585 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  30.36 
 
 
585 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  28.63 
 
 
588 aa  182  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  31.7 
 
 
570 aa  181  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  29.53 
 
 
585 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  29.53 
 
 
585 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  29.53 
 
 
585 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  29.53 
 
 
585 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  31.96 
 
 
576 aa  179  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  31.9 
 
 
574 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  29.91 
 
 
585 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  29.91 
 
 
585 aa  177  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  29.49 
 
 
570 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  29.91 
 
 
590 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  30.13 
 
 
585 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  32.33 
 
 
581 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  30.65 
 
 
592 aa  175  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  32.4 
 
 
549 aa  174  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  29.28 
 
 
592 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  30.49 
 
 
588 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  29.79 
 
 
578 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  30.04 
 
 
600 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  34.72 
 
 
551 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  30.53 
 
 
584 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  31.54 
 
 
606 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  32.1 
 
 
573 aa  167  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  29.08 
 
 
487 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  28.05 
 
 
587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  29.8 
 
 
578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  31.72 
 
 
564 aa  165  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  28.85 
 
 
591 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  30.75 
 
 
582 aa  164  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03456  hypothetical protein  28.1 
 
 
562 aa  162  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  29.95 
 
 
567 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  29.55 
 
 
573 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  29.95 
 
 
567 aa  161  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  31.25 
 
 
560 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  30.77 
 
 
568 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  29.41 
 
 
563 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  27.67 
 
 
583 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0119  sulfate permease family protein  28.6 
 
 
548 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  32.34 
 
 
573 aa  159  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  32.92 
 
 
552 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  30.05 
 
 
592 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  30.59 
 
 
570 aa  158  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  31.44 
 
 
556 aa  158  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002556  sulfate permease family protein  27.78 
 
 
556 aa  157  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790014  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  29.08 
 
 
550 aa  157  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  29 
 
 
499 aa  156  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  30.9 
 
 
570 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  30.82 
 
 
583 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  30.86 
 
 
553 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>