More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  92.65 
 
 
517 aa  921    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  100 
 
 
517 aa  993    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  63.04 
 
 
546 aa  561  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  59.06 
 
 
522 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  59.53 
 
 
522 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  58.41 
 
 
521 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  58.95 
 
 
522 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  58.95 
 
 
521 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  58.06 
 
 
521 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  58.75 
 
 
521 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  40.99 
 
 
584 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  39.43 
 
 
626 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  38.49 
 
 
603 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  39 
 
 
577 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  37.55 
 
 
608 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  39.02 
 
 
620 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  39.81 
 
 
603 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  39.81 
 
 
730 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  39.2 
 
 
599 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  39.66 
 
 
590 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  38.69 
 
 
620 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  31.24 
 
 
580 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  34.67 
 
 
729 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  36.02 
 
 
711 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  30.8 
 
 
573 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  41.78 
 
 
584 aa  236  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  32.97 
 
 
588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  40.15 
 
 
601 aa  230  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  32.74 
 
 
703 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  34.91 
 
 
588 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  33.93 
 
 
703 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  40.24 
 
 
698 aa  226  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  33.94 
 
 
585 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  34.56 
 
 
711 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  35.71 
 
 
584 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  31.58 
 
 
605 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.03 
 
 
591 aa  217  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  32.58 
 
 
604 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  31.07 
 
 
588 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  32.6 
 
 
558 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  30.71 
 
 
578 aa  207  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  28.94 
 
 
574 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.22 
 
 
574 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  33.7 
 
 
585 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  33.02 
 
 
581 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  28.19 
 
 
570 aa  192  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  31.24 
 
 
577 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  32.84 
 
 
605 aa  190  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  28.91 
 
 
597 aa  189  9e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  27.83 
 
 
571 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  29.79 
 
 
575 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  30.02 
 
 
583 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  31.98 
 
 
590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  30.07 
 
 
570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  30.85 
 
 
583 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2436  sulphate transporter  33.07 
 
 
549 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.59657  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.14 
 
 
579 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  27.24 
 
 
568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  31.94 
 
 
586 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  32.29 
 
 
588 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.3 
 
 
572 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  27.41 
 
 
568 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  27.59 
 
 
585 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  28.01 
 
 
592 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  28.75 
 
 
570 aa  177  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  26.68 
 
 
570 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  28.15 
 
 
585 aa  177  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  30.62 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  27.96 
 
 
585 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  27.97 
 
 
567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  28.21 
 
 
567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  28.81 
 
 
573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  27.78 
 
 
585 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  25.73 
 
 
568 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  28.28 
 
 
572 aa  170  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  29.72 
 
 
578 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  29.94 
 
 
555 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  27.78 
 
 
590 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  31.86 
 
 
573 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  26.48 
 
 
585 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  31.18 
 
 
545 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  26.48 
 
 
585 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  26.48 
 
 
585 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  26.48 
 
 
585 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  30.46 
 
 
586 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  28.82 
 
 
564 aa  167  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  26.93 
 
 
572 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  31.3 
 
 
544 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  26.72 
 
 
558 aa  164  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  23.16 
 
 
587 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  31.03 
 
 
571 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  28.29 
 
 
541 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  31.12 
 
 
632 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3641  sulfate permease  38.13 
 
 
708 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  27.87 
 
 
576 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  27.37 
 
 
581 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  27.91 
 
 
587 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  32.22 
 
 
571 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  24.47 
 
 
552 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  33 
 
 
574 aa  160  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>