More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0425 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  60.44 
 
 
599 aa  641    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  61.36 
 
 
603 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  100 
 
 
601 aa  1176    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  61.07 
 
 
620 aa  632  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  61.21 
 
 
584 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  63.74 
 
 
698 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  44.69 
 
 
577 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  40.67 
 
 
603 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  39.1 
 
 
608 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  41.96 
 
 
626 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  42.05 
 
 
584 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  38.9 
 
 
620 aa  362  8e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.74 
 
 
711 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  37.33 
 
 
703 aa  319  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  36.99 
 
 
711 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  36.22 
 
 
703 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  40.15 
 
 
521 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  38.26 
 
 
522 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  39.74 
 
 
521 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  39.37 
 
 
517 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  39.02 
 
 
521 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  39.96 
 
 
546 aa  283  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  35.68 
 
 
730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  40.45 
 
 
517 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  37.29 
 
 
522 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  36.69 
 
 
522 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  39.21 
 
 
521 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  35.88 
 
 
584 aa  262  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  29.64 
 
 
573 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  36.61 
 
 
588 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  34.48 
 
 
590 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  31.37 
 
 
585 aa  240  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  28.7 
 
 
580 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  30.84 
 
 
572 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.39 
 
 
586 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  28.99 
 
 
588 aa  227  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  29.88 
 
 
605 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  25.91 
 
 
587 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  31.2 
 
 
604 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  33.88 
 
 
591 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.22 
 
 
592 aa  216  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  31.75 
 
 
574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  29.12 
 
 
588 aa  211  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  29.84 
 
 
729 aa  211  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  24.91 
 
 
583 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  32.68 
 
 
583 aa  209  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  31.5 
 
 
605 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  29.95 
 
 
585 aa  208  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  29.41 
 
 
578 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  26.88 
 
 
571 aa  207  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  30.04 
 
 
570 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  29.61 
 
 
606 aa  206  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  25.92 
 
 
587 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  31.09 
 
 
588 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  31.27 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  29.8 
 
 
578 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  32.03 
 
 
558 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  24.04 
 
 
574 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  29.75 
 
 
565 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  29.29 
 
 
560 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  28 
 
 
567 aa  187  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  29.71 
 
 
577 aa  187  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  26.41 
 
 
569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  29.22 
 
 
574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  26.41 
 
 
569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  27.89 
 
 
573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  29.5 
 
 
590 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  26.91 
 
 
567 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  27.29 
 
 
597 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  26.68 
 
 
567 aa  184  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  31.57 
 
 
576 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  29.23 
 
 
586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  29.49 
 
 
568 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  29.3 
 
 
568 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  29.21 
 
 
575 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.57 
 
 
579 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  29.3 
 
 
568 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  30.84 
 
 
581 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  29.9 
 
 
585 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  29.02 
 
 
552 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  31.48 
 
 
556 aa  176  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  27.86 
 
 
567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  31.43 
 
 
582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  30.04 
 
 
592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  29.86 
 
 
584 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  29.98 
 
 
585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  25.52 
 
 
568 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  29.17 
 
 
570 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  30.06 
 
 
592 aa  174  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  25.23 
 
 
568 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  30.64 
 
 
571 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  29.52 
 
 
585 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  26.21 
 
 
570 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  26.67 
 
 
553 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  28.45 
 
 
590 aa  172  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  27.79 
 
 
574 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  25.73 
 
 
568 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  29.81 
 
 
736 aa  171  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  28.73 
 
 
585 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  28.95 
 
 
575 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>