More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1575 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  100 
 
 
570 aa  1144    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  76.68 
 
 
568 aa  845    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  64.53 
 
 
581 aa  692    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  51.88 
 
 
572 aa  566  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  51.14 
 
 
606 aa  544  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  48.39 
 
 
570 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  47.23 
 
 
568 aa  532  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  48.54 
 
 
556 aa  531  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  48.29 
 
 
553 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  46.56 
 
 
568 aa  522  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  46.9 
 
 
568 aa  521  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  46.79 
 
 
552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  45.99 
 
 
605 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  50.18 
 
 
559 aa  505  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  46.44 
 
 
552 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  47.45 
 
 
558 aa  495  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  48.79 
 
 
552 aa  496  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  46.25 
 
 
552 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  46.82 
 
 
551 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  46.07 
 
 
553 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  46.1 
 
 
551 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  48.67 
 
 
583 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.48 
 
 
579 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  43.27 
 
 
545 aa  481  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  45.65 
 
 
567 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  48.91 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  45.88 
 
 
567 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  46.98 
 
 
583 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  49.52 
 
 
573 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  47.25 
 
 
575 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  47.24 
 
 
572 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  44.67 
 
 
587 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  49.05 
 
 
551 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  46.18 
 
 
587 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  46.04 
 
 
563 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  44.46 
 
 
564 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  44.55 
 
 
560 aa  445  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  44.05 
 
 
563 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  48.51 
 
 
581 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  44.14 
 
 
583 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  47.78 
 
 
580 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  45.47 
 
 
560 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  46.07 
 
 
581 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  46.54 
 
 
555 aa  435  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  49.06 
 
 
568 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  45.64 
 
 
577 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  45.13 
 
 
553 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  44.16 
 
 
587 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  48.26 
 
 
559 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  46.31 
 
 
552 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  48.48 
 
 
553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  42.93 
 
 
541 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  43.81 
 
 
554 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  45.26 
 
 
545 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  45.35 
 
 
632 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2760  sulphate transporter  44.09 
 
 
607 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.207505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  40.43 
 
 
588 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  39.97 
 
 
587 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0511  sulphate transporter  45.49 
 
 
544 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0886491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  42.55 
 
 
558 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  39.97 
 
 
587 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  39.97 
 
 
587 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  39.97 
 
 
587 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3470  putative sulfate transporter YchM  41.18 
 
 
578 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  35.93 
 
 
563 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  50.73 
 
 
426 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  38.75 
 
 
585 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0960  sulphate transporter  41.89 
 
 
556 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  39.78 
 
 
590 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  39.78 
 
 
590 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  39.78 
 
 
590 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  39.57 
 
 
573 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  42.73 
 
 
586 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  41.55 
 
 
567 aa  364  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  41.34 
 
 
565 aa  362  9e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2268  putative sulfate transporter YchM  41.55 
 
 
572 aa  360  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  39.75 
 
 
565 aa  359  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  39.75 
 
 
565 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  38.39 
 
 
574 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1540  putative sulfate transporter YchM  41.22 
 
 
561 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0985805  normal  0.161381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1914  putative sulfate transporter YchM  41.22 
 
 
561 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.200297  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2342  putative sulfate transporter YchM  41.52 
 
 
560 aa  355  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  39.57 
 
 
565 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3674  putative sulfate transporter YchM  39.81 
 
 
575 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1978  putative sulfate transporter YchM  41.04 
 
 
561 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846232  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1356  putative sulfate transporter YchM  40.86 
 
 
561 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0275368  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1920  putative sulfate transporter YchM  41.04 
 
 
561 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0235525  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  38.89 
 
 
573 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1995  putative sulfate transporter YchM  41.96 
 
 
562 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2441  sulfate transporter  41.59 
 
 
550 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1353  putative sulfate transporter YchM  41.59 
 
 
550 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000101083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2420  putative sulfate transporter YchM  41.59 
 
 
550 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.643639  hitchhiker  0.00551985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1311  putative sulfate transporter YchM  41.59 
 
 
550 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000228855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01181  predicted transporter  41.77 
 
 
559 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1687  putative sulfate transporter YchM  41.77 
 
 
559 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000554758  normal  0.520634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1936  putative sulfate transporter YchM  41.77 
 
 
559 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016191  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01191  hypothetical protein  41.77 
 
 
559 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.818983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1792  sulfate transporter  40.58 
 
 
571 aa  333  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0608  putative sulfate transporter YchM  40.17 
 
 
594 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.288861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1370  putative sulfate transporter YchM  41.59 
 
 
559 aa  325  9e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000347462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>