More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0436 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  100 
 
 
116 aa  227  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  92.24 
 
 
116 aa  213  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  92.24 
 
 
116 aa  213  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2662  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 
120 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1512  rhodanese domain-containing protein  50.98 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.766741  normal  0.549953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  46.23 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.09 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  40 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  41.24 
 
 
98 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  41.24 
 
 
98 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  41.58 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  41.24 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  41.24 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  41.24 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
472 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  39.8 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  43.27 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  40.59 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  44.23 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  44.23 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  44.76 
 
 
356 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  44.74 
 
 
357 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  41.59 
 
 
461 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  44.23 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  38.26 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 
459 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  40.21 
 
 
459 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 
459 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  42.99 
 
 
356 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  47.37 
 
 
617 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  37.74 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 
356 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  33.98 
 
 
229 aa  66.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  32.35 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  44.19 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 
459 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  39.36 
 
 
459 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  35.78 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 
459 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.36 
 
 
550 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  35.85 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.36 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.29 
 
 
478 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1969  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.05 
 
 
587 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.602757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  34.74 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16570  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  43.66 
 
 
563 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0975833  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.79 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42 
 
 
390 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.71 
 
 
387 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  44.74 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  45.57 
 
 
106 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  31.96 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  38.39 
 
 
199 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  40.66 
 
 
194 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  39.42 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  39.78 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  40.51 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>