80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2293 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  42.33 
 
 		 194 aa  148  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  40.88 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 178 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  33.52 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  32.43 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  33.52 
 
 		 221 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  33.52 
 
 		 221 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  39.39 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  39.38 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  36.2 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33.15 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 225 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  38.75 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  38.75 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  38.75 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  40.99 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  38.75 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  38.12 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  38.12 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  39.62 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  39.62 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  39.62 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  39.62 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  38.99 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  33.14 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  39.77 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  36.53 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  42.59 
 
 		 168 aa  95.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  39.88 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 		 209 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.98 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  31.32 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  33.13 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  36.48 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  29.67 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 471 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1105  hypothetical protein  39.66 
 
 		 67 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2288  hypothetical protein  43.1 
 
 		 67 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 466 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1456  hypothetical protein  33.66 
 
 		 379 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.03 
 
 		 472 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 140 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1388  hypothetical protein  41.38 
 
 		 67 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.801628  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1527  hypothetical protein  32.67 
 
 		 379 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  29.37 
 
 		 685 aa  43.1  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2183  hypothetical protein  37.93 
 
 		 71 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00725141  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 470 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3104  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  24.55 
 
 		 154 aa  42  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2179  hypothetical protein  33.82 
 
 		 68 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000190781  hitchhiker  0.00000346737 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.27 
 
 		 471 aa  42  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  26.09 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1392  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  hitchhiker  0.000000000223509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1457  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000515055  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1445  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000274385  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 103 aa  41.2  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1582  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00572873  hitchhiker  0.000000000892194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  26.79 
 
 		 145 aa  41.6  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  22.12 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2776  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  25.58 
 
 		 117 aa  41.2  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2871  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.061034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2796  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000387625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0396  hypothetical protein  32.76 
 
 		 70 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  24.77 
 
 		 136 aa  41.2  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 		 161 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>