93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2183 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2183  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00725141  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2796  hypothetical protein  88.24 
 
 		 70 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000387625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2776  hypothetical protein  88.24 
 
 		 70 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1582  hypothetical protein  88.24 
 
 		 70 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00572873  hitchhiker  0.000000000892194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2871  hypothetical protein  88.24 
 
 		 70 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.061034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1457  hypothetical protein  88.24 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000515055  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1392  hypothetical protein  88.24 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  hitchhiker  0.000000000223509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1445  hypothetical protein  86.76 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000274385  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3104  hypothetical protein  85.29 
 
 		 70 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2475  hypothetical protein  85.29 
 
 		 70 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2441  hypothetical protein  81.43 
 
 		 70 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2690  hypothetical protein  86.36 
 
 		 70 aa  114  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2612  hypothetical protein  67.61 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1411  hypothetical protein  67.14 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1613  hypothetical protein  80 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0675428  hitchhiker  0.00154974 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4698  hypothetical protein  70.49 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0587  hypothetical protein  62.3 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000100  hypothetical protein  55.74 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1105  hypothetical protein  62.9 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1736  hypothetical protein  62.71 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00537203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3630  hypothetical protein  55.74 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1388  hypothetical protein  59.02 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.801628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0589  hypothetical protein  55.74 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.815479  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2242  hypothetical protein  55.74 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2479  hypothetical protein  54.84 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1127  hypothetical protein  57.38 
 
 		 67 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.222198  normal  0.339922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2288  hypothetical protein  60.66 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1300  hypothetical protein  55 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.570889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0969  hypothetical protein  51.67 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0106427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1672  hypothetical protein  49.18 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.495158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4202  hypothetical protein  53.23 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3711  hypothetical protein  51.52 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0883  hypothetical protein  51.61 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1346  hypothetical protein  48.39 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4303  hypothetical protein  51.61 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3851  hypothetical protein  47.83 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209751  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0244  hypothetical protein  54.1 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.373808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3768  hypothetical protein  47.83 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1091  hypothetical protein  48.39 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00223092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1210  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  54.24 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0993  hypothetical protein  52.46 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.984074 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1168  hypothetical protein  44.26 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0485265  normal  0.126303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3564  hypothetical protein  48.48 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0710872  normal  0.0244929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0492  hypothetical protein  58.06 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119962  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1351  hypothetical protein  46.77 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00580499  hitchhiker  0.000123196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4226  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3224  hypothetical protein  45.31 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0994  hypothetical protein  50.82 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3724  hypothetical protein  45.16 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0417243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2179  hypothetical protein  46.38 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000190781  hitchhiker  0.00000346737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3721  hypothetical protein  57.38 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0396  hypothetical protein  43.28 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3124  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2350  hypothetical protein  44.78 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3758  hypothetical protein  47.22 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3464  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000141728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3301  thiosulfate sulfurtransferase  45.21 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.967077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2398  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2741  hypothetical protein  47.62 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1237  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3342  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00840593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1458  hypothetical protein  50.85 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3933  hypothetical protein  42.62 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0208  rhodanese-related sulfurtransferase  40.91 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3849  hypothetical protein  43.33 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0057  hypothetical protein  47.46 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  38.71 
 
 		 256 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3745  hypothetical protein  43.06 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1175  hypothetical protein  42.62 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1998  hypothetical protein  43.48 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2365  hypothetical protein  43.48 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.71 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2917  hypothetical protein  33.85 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.043389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  37.93 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  37.93 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  37.93 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  37.93 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  36.21 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  44.9 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  37.93 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1366  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.88 
 
 		 738 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  36.21 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  36.21 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  36.21 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  36.21 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  36.21 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2318  hypothetical protein  35.38 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  36.21 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  36.21 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  34.48 
 
 		 172 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  40.35 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  34.48 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>