More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3833 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  79.15 
 
 
204 aa  315  5e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  50 
 
 
197 aa  168  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  54.25 
 
 
221 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  54.25 
 
 
221 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  54.25 
 
 
221 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 
225 aa  165  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  52.94 
 
 
192 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 
225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  49.72 
 
 
199 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  47.09 
 
 
194 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  41.8 
 
 
197 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  41.04 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  43.02 
 
 
177 aa  128  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
197 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  40 
 
 
194 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  39.46 
 
 
190 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  37.99 
 
 
201 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  34.68 
 
 
185 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  36.46 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  39.62 
 
 
182 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 
173 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  32.94 
 
 
181 aa  87.8  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  34.84 
 
 
175 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  35.67 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  33.76 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  31.82 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  31.82 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  31.82 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  36.18 
 
 
175 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  36.18 
 
 
175 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  36.18 
 
 
175 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  36.18 
 
 
175 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  36.18 
 
 
175 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  31.61 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  32.7 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  31.82 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  31.25 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  31.03 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.44 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  33.55 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.18 
 
 
568 aa  62.4  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
127 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 
103 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 
144 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.04 
 
 
141 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 
141 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  42 
 
 
109 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  41 
 
 
116 aa  58.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 
121 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0473  rhodanese-related sulfurtransferase  29.03 
 
 
237 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1694  putative sulfurtransferase  29.03 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  37.38 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 
130 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 
158 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.67 
 
 
173 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  31.31 
 
 
133 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
145 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.2 
 
 
566 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.2 
 
 
566 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  33.33 
 
 
136 aa  55.1  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  33.04 
 
 
128 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  35.14 
 
 
119 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  35.14 
 
 
119 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  36.9 
 
 
455 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.2 
 
 
132 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  35.14 
 
 
119 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 
128 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 
130 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  35.14 
 
 
110 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  35.14 
 
 
110 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.78 
 
 
390 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  38.75 
 
 
135 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 
176 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28.83 
 
 
141 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 
161 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 
140 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 
142 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  29.81 
 
 
170 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  32.93 
 
 
119 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  31.25 
 
 
551 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 
121 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>