More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2853 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
116 aa  234  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  46.67 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  42.7 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  36.36 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  41.86 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  43.82 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  43.82 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.26 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  41 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  43.18 
 
 
560 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
480 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.58 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 
278 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 
277 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 
190 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
224 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.07 
 
 
106 aa  60.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  44.05 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 
192 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  43.21 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  40 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.28 
 
 
393 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 
277 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  42.47 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.67 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
189 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
471 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  40.45 
 
 
221 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  39.02 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  43.66 
 
 
703 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 
133 aa  59.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  42.47 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  42.47 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 
284 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 
221 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  43.66 
 
 
703 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  42.47 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 
221 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1554  rhodanese-like sulfurtransferase protein  33.75 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000229638  normal  0.157594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  43.21 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.56 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  37.96 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
454 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  33.66 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
128 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  39.6 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  40 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
528 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  36 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  44.62 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  41 
 
 
218 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  34.83 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>