More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0691 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 158 aa  323  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  72.15 
 
 		 159 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  70.51 
 
 		 161 aa  237  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  67.74 
 
 		 155 aa  221  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  65.33 
 
 		 157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  64.71 
 
 		 157 aa  209  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  58.17 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  53.59 
 
 		 153 aa  167  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  42.37 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  40.16 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  40.71 
 
 		 128 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  40.71 
 
 		 128 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  34.56 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.1 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.71 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  38.95 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  31.54 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.07 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.86 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.95 
 
 		 390 aa  67.8  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  30.89 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.71 
 
 		 398 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  26.61 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  26.61 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  28.85 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.33 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36.89 
 
 		 354 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.64 
 
 		 392 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  29.06 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.58 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  28.06 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35 
 
 		 395 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  33.33 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.84 
 
 		 386 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  29.85 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.98 
 
 		 386 aa  61.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.19 
 
 		 346 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 395 aa  60.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.14 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  34.96 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  33.67 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.41 
 
 		 568 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.71 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  34.21 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  35.87 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.14 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1512  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.766741  normal  0.549953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2662  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553385  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  29.2 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.7 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  36.21 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 455 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.47 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.16 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  37.07 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  37.07 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.07 
 
 		 393 aa  57.4  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  33.11 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  35.64 
 
 		 778 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.67 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  29.84 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.71 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 399 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  32.73 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.58 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.45 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  38.38 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  29 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>