More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2871 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  81.46 
 
 		 178 aa  300  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  59.43 
 
 		 175 aa  207  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  59.41 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  59.41 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  59.52 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  58.82 
 
 		 174 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  58.82 
 
 		 174 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  58.82 
 
 		 174 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  58.82 
 
 		 174 aa  194  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  58.93 
 
 		 174 aa  193  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  58.82 
 
 		 174 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  55.09 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  55.09 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  55.09 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  55.09 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  54.49 
 
 		 175 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  51.46 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  50.88 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  48.24 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  44.38 
 
 		 185 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  42.94 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  43.5 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  45.93 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  40.74 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  38.89 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  38.07 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 209 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  33.51 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  33.51 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  33.51 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  34.05 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.48 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 225 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 199 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  34.24 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  33.76 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  32.78 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  33.12 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  32.48 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  34.46 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 		 220 aa  72  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.61 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.15 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.63 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  28.41 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  35.96 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  41 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  33.96 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  29.59 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  35.35 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  44.71 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  32.35 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 		 136 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0403  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.059592  hitchhiker  0.000249249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  36.45 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  27.35 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  29.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.38 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  28.04 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  36 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 102 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  33.64 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 129 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 123 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.54 
 
 		 378 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  36.71 
 
 		 356 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 103 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4822  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 480 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 113 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 		 271 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  30.48 
 
 		 110 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>