More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2434 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 
356 aa  737    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  69.38 
 
 
354 aa  510  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  69.38 
 
 
354 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  69.38 
 
 
354 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  67.79 
 
 
354 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  67.79 
 
 
354 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.41 
 
 
813 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.53 
 
 
938 aa  264  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.83 
 
 
817 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.05 
 
 
831 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.08 
 
 
817 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.75 
 
 
864 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  35.47 
 
 
820 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.16 
 
 
837 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.78 
 
 
834 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  54.25 
 
 
159 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  54.25 
 
 
159 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  53.59 
 
 
159 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  53.59 
 
 
159 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  53.59 
 
 
159 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  53.59 
 
 
159 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  53.59 
 
 
159 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  53.59 
 
 
159 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  52.94 
 
 
159 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  50 
 
 
160 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  49.38 
 
 
160 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.39 
 
 
158 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  42.76 
 
 
196 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  41.45 
 
 
192 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  44.52 
 
 
139 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  41.45 
 
 
191 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  33.92 
 
 
201 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  40.26 
 
 
158 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  36.84 
 
 
159 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  41.1 
 
 
126 aa  105  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  26.47 
 
 
560 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  34.87 
 
 
158 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  32.35 
 
 
169 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  29.41 
 
 
163 aa  84.3  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  33.53 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  32.35 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  31.76 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  32.94 
 
 
169 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  30.49 
 
 
170 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  34.62 
 
 
166 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  29.41 
 
 
171 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  32.12 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  28.49 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  29.24 
 
 
200 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  31.33 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  30.3 
 
 
170 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  27.72 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  27.92 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  30.32 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  30.56 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  30.56 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  42.71 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 
143 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 
98 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  45.95 
 
 
100 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  41.94 
 
 
97 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 
127 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  28.89 
 
 
203 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  30 
 
 
181 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  27.22 
 
 
169 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
220 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  30.19 
 
 
140 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 
116 aa  63.9  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  47.22 
 
 
148 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  29.73 
 
 
131 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  31.17 
 
 
156 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  31.17 
 
 
156 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  52.11 
 
 
117 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.55 
 
 
138 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  28.95 
 
 
159 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  39.58 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  30.88 
 
 
170 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 
123 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  41.43 
 
 
116 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 
122 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 
130 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  30.15 
 
 
170 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  42.67 
 
 
189 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  34.74 
 
 
186 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  34.74 
 
 
186 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  38.61 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
170 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  27.49 
 
 
161 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  31.11 
 
 
169 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  34.74 
 
 
186 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 
282 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.1 
 
 
107 aa  60.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 
186 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 
186 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  32.08 
 
 
108 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 
127 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  36.67 
 
 
379 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1537  rhodanese-related sulfurtransferase  37.21 
 
 
106 aa  60.1  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>