88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1738 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  78.57 
 
 
126 aa  209  9e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.79 
 
 
813 aa  128  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  47.1 
 
 
354 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  47.1 
 
 
354 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  46.45 
 
 
354 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  46.45 
 
 
354 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  46.45 
 
 
354 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  44.52 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  43.31 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  43.31 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  43.31 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  43.31 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  43.31 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  43.31 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  43.31 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  42.68 
 
 
159 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  42.68 
 
 
159 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.47 
 
 
938 aa  109  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  39.13 
 
 
820 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.35 
 
 
817 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.14 
 
 
831 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  40.25 
 
 
160 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  37.34 
 
 
196 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  40.25 
 
 
160 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 
817 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  37.82 
 
 
191 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 
864 aa  103  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  37.34 
 
 
192 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.88 
 
 
837 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.11 
 
 
158 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.4 
 
 
834 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  31.65 
 
 
201 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  33.76 
 
 
163 aa  87.8  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  33.53 
 
 
169 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  33.53 
 
 
169 aa  87.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  33.93 
 
 
169 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  32.94 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  32.48 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  33.96 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  32.12 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  28.75 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  31.76 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  30.66 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  35.07 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  36.57 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  30.57 
 
 
560 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  30 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.88 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  32.14 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  30.22 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  26.04 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  33.8 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  31.21 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  29.41 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  27.34 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244702  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  30.3 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  31.21 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  30.3 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  26.63 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  28.29 
 
 
195 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  27.68 
 
 
177 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  27.85 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  26.54 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  32.47 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  26.36 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  33.57 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.865789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  26.49 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  27.15 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  25.88 
 
 
169 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  27.78 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  27.41 
 
 
169 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  29.27 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  25.4 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  28.83 
 
 
203 aa  57.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  29.63 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  27.2 
 
 
196 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  24.39 
 
 
181 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  25.83 
 
 
210 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  27.21 
 
 
193 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1321  hypothetical protein  28.99 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  26.81 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  41.3 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  25.89 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>