90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1961 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  348  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  94.08 
 
 
169 aa  332  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  92.31 
 
 
169 aa  324  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  88.17 
 
 
169 aa  318  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  88.76 
 
 
169 aa  313  7e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  80 
 
 
170 aa  288  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  79.39 
 
 
170 aa  280  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  78.18 
 
 
170 aa  280  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  63.69 
 
 
169 aa  227  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  53.89 
 
 
175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  53.89 
 
 
207 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  54.44 
 
 
203 aa  181  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  47.31 
 
 
200 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  51.79 
 
 
156 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  51.79 
 
 
156 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  49.39 
 
 
171 aa  157  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  47.59 
 
 
181 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  44.89 
 
 
177 aa  144  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  44.12 
 
 
196 aa  137  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  42.94 
 
 
210 aa  135  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  44.12 
 
 
190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  49.7 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  43.45 
 
 
197 aa  134  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  52.66 
 
 
156 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  41.07 
 
 
195 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2645  hypothetical protein  51.52 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.36 
 
 
817 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  41.98 
 
 
130 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.47 
 
 
831 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  41.36 
 
 
129 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  35.98 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.79 
 
 
158 aa  99  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  36.14 
 
 
160 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.06 
 
 
938 aa  94  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  33.94 
 
 
160 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  31.71 
 
 
192 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  32.39 
 
 
163 aa  91.3  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.07 
 
 
817 aa  90.9  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  33.92 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  31.95 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  38.32 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  32.7 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  31.95 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  30.49 
 
 
196 aa  89  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  31.36 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  31.36 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  31.18 
 
 
159 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  31.18 
 
 
159 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  31.18 
 
 
159 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  31.18 
 
 
159 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  32.94 
 
 
139 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.57 
 
 
864 aa  86.3  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  31.76 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  32.77 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  32.14 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.12 
 
 
138 aa  85.5  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  33.13 
 
 
820 aa  84.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.93 
 
 
834 aa  84  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  33.93 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  31.76 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.67 
 
 
837 aa  82.4  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 
354 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 
354 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.82 
 
 
813 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  34.42 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244702  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  33.93 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  32.74 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  30.72 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  35.84 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  29.75 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  35.5 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  31.29 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  26.9 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  27.94 
 
 
560 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  25.29 
 
 
159 aa  58.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  31.95 
 
 
143 aa  58.2  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  27.89 
 
 
127 aa  51.6  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1904  hypothetical protein  40.68 
 
 
125 aa  51.6  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000231633  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  26.51 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  29.52 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  23.46 
 
 
193 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  22.75 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  28.57 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1443  DsrE family protein  28.77 
 
 
116 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  29.58 
 
 
116 aa  42  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>