More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2515 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 
354 aa  731    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
354 aa  731    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
354 aa  731    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  74.01 
 
 
354 aa  534  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  74.01 
 
 
354 aa  534  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  69.38 
 
 
356 aa  510  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.73 
 
 
813 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.48 
 
 
938 aa  275  6e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
817 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.86 
 
 
831 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.54 
 
 
817 aa  249  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.86 
 
 
820 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.95 
 
 
864 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.72 
 
 
837 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.94 
 
 
834 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  52.29 
 
 
159 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  52.29 
 
 
159 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  51.63 
 
 
159 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  51.63 
 
 
159 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  51.63 
 
 
159 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  51.63 
 
 
159 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  50.98 
 
 
159 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  51.63 
 
 
159 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  51.63 
 
 
159 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  49.67 
 
 
160 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  48.37 
 
 
160 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.74 
 
 
158 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  42.11 
 
 
196 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  42.11 
 
 
192 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  46.45 
 
 
139 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  40.79 
 
 
191 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  36.6 
 
 
201 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  40.91 
 
 
158 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  36.18 
 
 
159 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  41.1 
 
 
126 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  35.53 
 
 
158 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  27.73 
 
 
560 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  29.38 
 
 
163 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  33.99 
 
 
166 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  31.64 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  31.1 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  30.59 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  30.59 
 
 
169 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  29.41 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  30.59 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  31.95 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  29.27 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  29.27 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  38.24 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  38.24 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  38.24 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  38.24 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  38.24 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  38.24 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  38.24 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  37.25 
 
 
127 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  37.25 
 
 
127 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  31.29 
 
 
207 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  31.1 
 
 
175 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  27.27 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 
127 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  38.89 
 
 
80 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  38.89 
 
 
80 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  41.41 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  46.97 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  31.21 
 
 
159 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  28.16 
 
 
181 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  49.3 
 
 
103 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  42.86 
 
 
77 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  34.72 
 
 
80 aa  67  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  41.43 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  40 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  43.48 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  30.32 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  44.12 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  26.62 
 
 
196 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  35.71 
 
 
92 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  37.97 
 
 
137 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  30.5 
 
 
195 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  44.78 
 
 
78 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  41.18 
 
 
72 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  38.57 
 
 
75 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  26.92 
 
 
190 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  37.37 
 
 
186 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.55 
 
 
138 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  37.5 
 
 
186 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1537  rhodanese-related sulfurtransferase  40.43 
 
 
106 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  44.87 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  37.5 
 
 
186 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  37.84 
 
 
78 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  36.36 
 
 
186 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  36.36 
 
 
186 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>