83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2495 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  360  6e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  359  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  57.71 
 
 		 200 aa  217  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  57.14 
 
 		 169 aa  210  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  56 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  55.62 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  53.85 
 
 		 169 aa  197  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  53.89 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  53.25 
 
 		 169 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  54.22 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  52.94 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  52.69 
 
 		 169 aa  190  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  54.22 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  49.1 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  49.1 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  47.31 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  48.52 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  41.48 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  48.52 
 
 		 156 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  40.94 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  38.86 
 
 		 197 aa  130  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  41.07 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  41.07 
 
 		 190 aa  127  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  38.1 
 
 		 210 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  38.1 
 
 		 196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2645  hypothetical protein  45.78 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.3 
 
 		 817 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.21 
 
 		 831 aa  85.1  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  32.17 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.16 
 
 		 938 aa  79  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  33.53 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  34.76 
 
 		 820 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.9 
 
 		 817 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.86 
 
 		 813 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  34.12 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.76 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  28 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  27.56 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244702  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  31.1 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  31.33 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  31.1 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  31.1 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  26.85 
 
 		 170 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  29.31 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  25.83 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  29.7 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  26.7 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  32.35 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  29.59 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  25.71 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  29.59 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  30.18 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  29.59 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.25 
 
 		 864 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  29.59 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.64 
 
 		 837 aa  67  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  29.59 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  29.59 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  29.59 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  30.3 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  29.59 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  25.14 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  32.52 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  30.3 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  28.57 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  29.7 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.33 
 
 		 834 aa  64.3  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  34.38 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  28.16 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  30.41 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  28.16 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  29.49 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.81 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  27.06 
 
 		 159 aa  50.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  24.84 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  38.1 
 
 		 127 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  24.44 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  24.82 
 
 		 560 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0499089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>