90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1185 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  91.67 
 
 
196 aa  352  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  80.21 
 
 
191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.32 
 
 
831 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  44.87 
 
 
160 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.86 
 
 
834 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.37 
 
 
817 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  44.87 
 
 
160 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  44.23 
 
 
159 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  44.87 
 
 
159 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.71 
 
 
817 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  44.23 
 
 
159 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  44.23 
 
 
159 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  44.23 
 
 
159 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  44.23 
 
 
159 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  44.23 
 
 
159 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  43.59 
 
 
159 aa  147  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  43.59 
 
 
159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  46.15 
 
 
158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.31 
 
 
813 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  42.86 
 
 
820 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.06 
 
 
837 aa  142  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.7 
 
 
864 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44 
 
 
938 aa  136  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  43.71 
 
 
354 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  43.71 
 
 
354 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  42.11 
 
 
354 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
354 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
354 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  41.45 
 
 
356 aa  124  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  36.36 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  38.96 
 
 
163 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  37.34 
 
 
139 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  32.9 
 
 
201 aa  101  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  38.1 
 
 
126 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  33.9 
 
 
177 aa  97.8  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  31.61 
 
 
159 aa  96.7  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  31.71 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  31.95 
 
 
169 aa  92  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  36.71 
 
 
560 aa  91.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  31.58 
 
 
169 aa  91.7  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  31.03 
 
 
169 aa  91.3  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  36.31 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  34.84 
 
 
156 aa  85.1  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  85.1  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  29.7 
 
 
169 aa  84.3  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  28.4 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  30.85 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  29.01 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  27.81 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  28.65 
 
 
170 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  30 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  32.91 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  28.42 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  32.5 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  29.81 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  29.73 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.19 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  28.11 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  29.48 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  26.49 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  35.95 
 
 
130 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  31.41 
 
 
129 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  28.17 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  30.34 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  32.26 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  30.83 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  28.96 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  30.3 
 
 
175 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  30.08 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  30.08 
 
 
169 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  29.32 
 
 
170 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  30.08 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  25.17 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  31.01 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  25.74 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  29.01 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2645  hypothetical protein  30.32 
 
 
155 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  30.23 
 
 
137 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.865789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  27.88 
 
 
133 aa  49.3  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  28.24 
 
 
116 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  27.74 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1443  DsrE family protein  27.06 
 
 
116 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  28.95 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  27.55 
 
 
149 aa  41.6  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>